当前解析结果
SmilChr06G000714| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000714 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000714 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000714 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 6466654 - 6469206 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988264 |
|---|---|
| GeneID | 130988264 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988264 |
| 原始查询 | LOC130988264 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988264 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057768051.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057768051.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057768051.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768051.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768051.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:6467435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr6:6467450 |
GCC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 24 | B100,B103,B106,B108,B13,B17,B22,B23,B27,B36,B38,B39,B51,B57,B64,B73,B81,B98,C1,C55,C58,C71,C79,C80 |
Chr6:6467459 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr6:6467488 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:6467511 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr6:6467941 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B61 |
Chr6:6467941 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B61 |
Chr6:6467993 |
TTG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A25,B110,B121,B15,B22,B29,B42,B43,B49,B58,B60,B62,B67,B72,B79,C14,C18,C34,C37,C41,C44,C45,C55,C73,C78,C84,D1,D2,D5,D6 |
Chr6:6468033 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:6468322 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B109,B62,B7,C85 |
Chr6:6468369 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,B77,C38 |
Chr6:6469040 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A8,A9,B127,B13,B18,B88,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。