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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000720`

染色体: Chr06 坐标: 6571914-6573882 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000720`
名称	SmilChr06G000720
描述	cucumber peeling cupredoxin-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6571914 - 6573882 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988271`
GeneID	`130988271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988271`
原始查询	`LOC130988271`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cucumber peeling cupredoxin-like
产物	cucumber peeling cupredoxin-like
Arabidopsis	`AT5G20230` (BCB) blue-copper-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832145] identity=44.8; qcov=0.51; evalue=8.1e-29; confidence=medium
Rice	`Os08g0137800` (OsUCL24) - identity=40; qcov=0.592; evalue=6.74e-25; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768056.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057768056.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768056.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768056.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6572247`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C25
`Chr6:6572247`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C25
`Chr6:6572273`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A14,A15,A19,A4,B1,B107,B109,B11,B120,B125,B126,B134,B137,B18,B20,B30,B38,B45,B46,B63,B72,B83,B95,B97,C2,C20,C34,C38,C44,C48,C51,C52,C59,C62,C68,C75,D10
`Chr6:6572365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C82
`Chr6:6572563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B24,C39,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768056.1

245 aa

122

245

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 35-119 aa

XP_057768057.1

245 aa

122

245

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 35-119 aa

XP_057768058.1

245 aa

122

245

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 35-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768056.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	35	119	1.6e-20	73.6	Plastocyanin-like domain
`XP_057768057.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	35	119	1.6e-20	73.6	Plastocyanin-like domain
`XP_057768058.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	35	119	1.6e-20	73.6	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912073.1
TTGGGGTAATATCTAGTTAGTTAAATACTATAAATTCTCCTTAAATCCAAATATCAATTCAATTCAGCAAAAATAAGTGAAAATTGTAATTATGTGGGTTTTCGCCGACGTCAATAATGTTGGCTAAATATTTGAATACTGTAGCAATTATGTGAGTCATGGGATGTATTAAGATTTGAAGTGAAAAGTCATAGTTTGTTTAAATTATTATTGTCCAATTGAAAACAATTATAGGAGTGGATGTGTTGACCGTATTATAT...

XM_057912074.1
TAGCAATAGCAGTAGCATAGTGGTACACTATTAGCACATGCATAAGTGATAGTAATAAATAAATAAATAAAATTGATGACATAATATTATATGCAAAAAGGCCGACATGGGATGTTGCATCCGAGAGGAATTCCACTATCACATAAATTTGAGTGTGTAAGAAATTGAGGTTGAAAACAGACTAGTCAATCTCTCTCTCTCTCTAGAATACTGAAGAAGAGAGGGGCGACCAGAGAACATATACAAGCAAGGAAGGAAGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130988271
ATGGGTTTGGATGGTCGTGGCTTTCTTGTGGCCGTGCTCGTGGCGGCGGCCCTCGTCGGAAAAGCGTCTGCGGCTACCTATATTGTCGGAGACAGTCTAGGCTGGAGTATTCCTAGCAGCCCCACCGACTACGCCACCTGGGCTAGTCGCCATGTTTTTACATCTGGAGATGTTCTTGTGTTCAATTTCATAACAGGGCAGCACGATGTAGCTGAAGTGAGTAAGGCAGCATTTGATAGTTGTAGCTCCACCGCCCCCTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057768056.1
MGLDGRGFLVAVLVAAALVGKASAATYIVGDSLGWSIPSSPTDYATWASRHVFTSGDVLVFNFITGQHDVAEVSKAAFDSCSSTAPLVLATVGPWNTTLNATGEHHYICTFGTHCSLGQKLAINVTAASSPSPSPAPSPPVVPTPAPAPAPGVAPTPPGSPSPSPTPTPTPTPAPTPGSPSSSPSPTPGSPSSTPGGSPSPGTPGAAPSTPEGPPAPPSPGSSATIATMSATSVVFAWVALGLIM

XP_057768057.1
MGLDGRGFLVAVLVAAALVGKASAATYIVGDSLGWSIPSSPTDYATWASRHVFTSGDVLVFNFITGQHDVAEVSKAAFDSCSSTAPLVLATVGPWNTTLNATGEHHYICTFGTHCSLGQKLAINVTAASSPSPSPAPSPPVVPTPAPAPAPGVAPTPPGSPSPSPTPTPTPTPAPTPGSPSSSPSPTPGSPSSTPGGSPSPGTPGAAPSTPEGPPAPPSPGSSATIATMSATSVVFAWVALGLIM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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