当前解析结果
SmilChr06G000757| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000757 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000757 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000757 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 7022721 - 7025178 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988305 |
|---|---|
| GeneID | 130988305 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988305 |
| 原始查询 | LOC130988305 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988305 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057768101.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057768101.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057768101.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:7022862 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B20 |
Chr6:7022862 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B20 |
Chr6:7022875 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C11 |
Chr6:7022917 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B20,C72 |
Chr6:7022927 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr6:7022931 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr6:7022996 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr6:7023200 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr6:7023201 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr6:7024933 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C17 |
Chr6:7024947 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,B133,C54,C71 |
Chr6:7024950 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,A14,B113,C55,C79 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。