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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000762`

染色体: Chr06 坐标: 7058574-7067977 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000762`
名称	SmilChr06G000762
描述	DNA mismatch repair protein MSH7
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7058574 - 7067977 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988307`
GeneID	`130988307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988307`
原始查询	`LOC130988307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA mismatch repair protein MSH7
产物	DNA mismatch repair protein MSH7
Arabidopsis	`AT3G24495` (MSH7) MUTS homolog 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822040] identity=58.8; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0180600` - identity=55.1; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006298 (mismatch repair); GO:0030983 (mismatched DNA binding); GO:0032301 (MutSalpha complex); GO:0140664 (ATP-dependent DNA damage sensor activity)
KEGG	smil03430 (Mismatch repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00488 (MutS_V); PF01624 (MutS_I); PF05188 (MutS_II); PF05192 (MutS_III)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768103.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768103.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768103.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768103.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768103.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7058862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:7058870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B29,C57
`Chr6:7058874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:7058914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B82
`Chr6:7059019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B16,C16,C52,C85
`Chr6:7060581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C52
`Chr6:7060800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C40,C43
`Chr6:7060822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr6:7061812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B137,C48
`Chr6:7061963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C18,C37
`Chr6:7061967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B97,C28,C46,C81
`Chr6:7062828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768103.1

1066 aa

533

1066

MutS_I

MutS_II

MutS_III

MutS_V

PF01624 MutS_I 237-348 aa PF05188 MutS_II 357-498 aa PF05192 MutS_III 521-739 aa PF00488 MutS_V 810-1002 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768103.1`	Pfam	`PF01624`	MutS_I	Domain	237	348	2e-30	106.0	MutS domain I
`XP_057768103.1`	Pfam	`PF05188`	MutS_II	Domain	357	498	1.9e-13	51.7	MutS domain II
`XP_057768103.1`	Pfam	`PF05192`	MutS_III	Domain	521	739	1.2e-36	127.6	MutS domain III
`XP_057768103.1`	Pfam	`PF00488`	MutS_V	Domain	810	1002	2.1e-73	247.1	MutS domain V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912120.1
ATTGTATTTTGGCGCCAGTTTCTGACCTCCCAACTAGTAAGCCCTCGCCACCGGAAATCCAAAATGCAGCGGCAGAAATCCATACTCTCCTTCCTCAAGAAACCAGAGGCCTCCGCCGGAGGCAAACCCACCGTTGCCGACGGAGAAATCAGAGGAACCGACACTCCACCCGAGAAGGTGCCCCGTCGGATATTTTCGGACAGCCGGCCTTCTCTCTTCTCCAGCATTAAGCACAAGTTCGCAAAAGTTGACAATTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988307
ATGCAGCGGCAGAAATCCATACTCTCCTTCCTCAAGAAACCAGAGGCCTCCGCCGGAGGCAAACCCACCGTTGCCGACGGAGAAATCAGAGGAACCGACACTCCACCCGAGAAGGTGCCCCGTCGGATATTTTCGGACAGCCGGCCTTCTCTCTTCTCCAGCATTAAGCACAAGTTCGCAAAAGTTGACAATTCCACAAACTCTTCATCTAACACCAGGTGTGATGGGGATGAAAATTTTACTATTCGGTCTCTTCCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768103.1
MQRQKSILSFLKKPEASAGGKPTVADGEIRGTDTPPEKVPRRIFSDSRPSLFSSIKHKFAKVDNSTNSSSNTRCDGDENFTIRSLPLRFDASEDLGNGYLVSKQPSDQHVLSSSRTVCPEGGKGSLFLKTLEDDVLGPETPGMRPLVPRLKRVQEDIYNLEEKADFSLQDNRKRMKLEQASDVSKKIHDEDCDTVSKFEWLHKSRIKDANGRKPMDPLYDKRTLYIPPEALGKMSASQKQYWDVKRQYMDVILFFKVGKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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