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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000766`

染色体: Chr06 坐标: 7135218-7141830 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000766`
名称	SmilChr06G000766
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7135218 - 7141830 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988312`
GeneID	`130988312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988312`
原始查询	`LOC130988312`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
产物	probable ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD14
Arabidopsis	`AT4G13350` (NIG) NSP (nuclear shuttle protein)-interacting GTPase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826966] identity=42.8; qcov=1.02; evalue=1.97e-130; confidence=medium
Rice	`Os02g0208900` (OJ1006_A02.21-1) - identity=39; qcov=0.96; evalue=1.9e-104; confidence=medium
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity)
KEGG	-
Pfam	PF01412 (ArfGap)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057768108.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057768108.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.40000	`XP_057768108.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057768108.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057768108.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7135688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C42
`Chr6:7136185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B78,C23
`Chr6:7136517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr6:7136676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B78,C23
`Chr6:7136730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C42
`Chr6:7137034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B54,C7
`Chr6:7137035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:7137376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:7138050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768108.1

656 aa

328

656

ArfGap

PF01412 ArfGap 12-122 aa

XP_057768109.1

656 aa

328

656

ArfGap

PF01412 ArfGap 12-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768108.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	12	122	1.2e-27	97.0	Putative GTPase activating protein for Arf
`XP_057768109.1`	Pfam	`PF01412`	ArfGap	Domain	12	122	1.2e-27	97.0	Putative GTPase activating protein for Arf

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912125.1
GGAGCAGTCATGTTAGACCTTAGTTTTCTTTGTAACAGTCAATGCGCGGAGCAGCCTATGTCTGGGCTGCCTCTCCCTTAAATCTCTCATTCATTCAGTCCCTCGCTCTCGCATTAAATATTCTCTCTCTCCACGTTCTCTTTTCTACGTTTTTTTCCTACGTTTTCTACAGCAAAAGGGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTTCTCACTTCTCTCTCTCTCTACTCTTTGGTAAAGTTGAGCTGTAAAGGATAGACGCGAGA...

XM_057912126.1
AATCTCTCATTCATTCAGTCCCTCGCTCTCGCATTAAATATTCTCTCTCTCCACGTTCTCTTTTCTACGTTTTTTTCCTACGTTTTCTACAGCAAAAGGGCGCTGTCTTTCTCTCTCTCTTCTCACTTCTCTCTCTCTCTACTCTTTGGTAAAGTTGAGCTGTAAAGGATAGACGCGAGATCCGTCCTCCTTCATTGATTTATGAAATTGCGCTTCACCGATCAGGTCGCTCATTTATTCCTTCTGCTTCTGTTAAATTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988312
ATGGCGAACCGGAAGGAGGACGAGAAGAATGAGAGAACTATACGGAATCTTCTAAAGCTTCCTGAGAATCGCCGGTGTATTAACTGCAACAGCTTGGGGCCCCAATATGTATGTACCAGCTTCTCGACATTTGTCTGTACAACCTGCAGTGGGATTCATCGGGAGTTCACGCACAGAGTGAAGTCGGTATCTATGGCTAAATTTACTCCACAAGAAGTTAGTGCACTTCAAGGAGGAGGAAATGCGAGTGGTAGAGAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768108.1
MANRKEDEKNERTIRNLLKLPENRRCINCNSLGPQYVCTSFSTFVCTTCSGIHREFTHRVKSVSMAKFTPQEVSALQGGGNASGREIYLKEWDPQRNSLPDGSNVDRLRDFIKHVYVDRRYTGEKNVEKPPRAKMGETEDFNGNRRADNYQGSRSPPYDDSFDRRYGDRSSSGGRSPSYDQDNRQSGDFKKSPAKEVVNDWRREDRFGNGRRSDEGSKLEIRSPDHRKDSDISSPPVVRPVRDILGDNVSPLRVIEPPKA...

XP_057768109.1
MANRKEDEKNERTIRNLLKLPENRRCINCNSLGPQYVCTSFSTFVCTTCSGIHREFTHRVKSVSMAKFTPQEVSALQGGGNASGREIYLKEWDPQRNSLPDGSNVDRLRDFIKHVYVDRRYTGEKNVEKPPRAKMGETEDFNGNRRADNYQGSRSPPYDDSFDRRYGDRSSSGGRSPSYDQDNRQSGDFKKSPAKEVVNDWRREDRFGNGRRSDEGSKLEIRSPDHRKDSDISSPPVVRPVRDILGDNVSPLRVIEPPKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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