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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002937`

染色体: Chr01 坐标: 48149548-48151258 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002937`
名称	SmilChr01G002937
描述	squamosa promoter-binding-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48149548 - 48151258 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988313`
GeneID	`130988313`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988313`
原始查询	`LOC130988313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding-like protein 3
产物	squamosa promoter-binding-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G43270` (SPL2) squamosa promoter binding protein-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834345] identity=80.5; qcov=0.252; evalue=3.56e-41; confidence=weak
Rice	`Os06g0703500` (OsSPL12) - identity=41.7; qcov=0.775; evalue=6.15e-50; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988313

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768114.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768114.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768114.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768114.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48150261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:48150273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:48150319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C8
`Chr1:48150319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:48150471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C40
`Chr1:48150497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B122,B23,B30,C53
`Chr1:48150880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768114.1

325 aa

162

325

SBP

PF03110 SBP 79-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768114.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	79	152	2.1e-32	112.0	SBP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912131.1
ATCCTAGTGCGAGTGGCGGTAGAGAGCGTGTTTGGTCTGAGCGTAAATGGAAAGAATGGCGTCGACCGCACATGGTAGGGGAGAGTGAATGGCGTCCATTGTTGTGGGACTCTCTAGCAAGCTATGTAGCCTGTTTTCCTAGTGGGGAACACTTGCATTCTGCCACCTACCTTCCATATTTAAGCCCCCTCCCTCCTCCTCCATGTTGGAGCACCTCTAATGGAGGGCGACTCTGCCGGTCTGGAGTGGGAGAATCTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988313
ATGGAGGGCGACTCTGCCGGTCTGGAGTGGGAGAATCTCGCCCTCTTCTCCTCCAAGCCCCTCCACCCCTTCTCCATGCCCACCGACTTCTACCACGACCCCGACCTCAGCCTCGGCCGCCACCCCTTCGCCTCCCCCTCCCCCTCCCCTGCCCCCTCTTCCATTCCCGTTTCCGTATCTTCCACCCCCACCAAGCGGTCCCGCGCCTCCTACCACAATATGCAGAACCCCTGCTGCCAGGTCGAGGGCTGCAACCTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768114.1
MEGDSAGLEWENLALFSSKPLHPFSMPTDFYHDPDLSLGRHPFASPSPSPAPSSIPVSVSSTPTKRSRASYHNMQNPCCQVEGCNLDLKLAKDYHRRHRICETHSKSPKVIVAGMERRFCQQCSRFHDLSEFDDKKRSCRRRLSDHNARRRRVQPESIQLTSSPALYTDQRQQQQQQQQNVLLNGLPVSSWENSMSRHALLRPPKLNEDLLLHMDPIHRSTPRILDQCVHNNSSMAPDLLSAHSLLSSNSWSLNEGESSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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