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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000783`

染色体: Chr06 坐标: 7330329-7333609 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000783`
名称	SmilChr06G000783
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7330329 - 7333609 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988328`
GeneID	`130988328`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988328`
原始查询	`LOC130988328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
产物	leucine-rich repeat extensin-like protein 4
Arabidopsis	`AT3G24480` (AT3G24480) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822038] identity=73.2; qcov=0.495; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os01g0594300` (P0451D05.14-2) - identity=58.6; qcov=0.456; evalue=4.74e-146; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988328

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057768125.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057768125.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768125.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768125.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7330998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr6:7331021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:7331065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr6:7331158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D7
`Chr6:7331326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B54,B74,C67,D11
`Chr6:7331368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B66,B94,C8,D2,D7
`Chr6:7331520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr6:7331645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr6:7331755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B37,B46,B51,B80
`Chr6:7331812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B135,B56,B96,C73
`Chr6:7331890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B130,C13,C65,D6
`Chr6:7331977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768125.1

747 aa

374

747

LRRNT_2

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 88-120 aa PF00560 LRR_1 297-319 aa PF00560 LRR_1 321-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768125.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	88	120	0.00028	21.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057768125.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	297	319	4.3e-15	53.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057768125.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	321	343	4.3e-15	53.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912142.1
CGGTTGTTGCGTTCCTTTATAGGAAAAGGAAAAAATATAGAAATCTTTTTGAGGGCATTATTCGAAACTTTAGCTGAGGAGGAGCGCGTTGAACATAAATGTGTTAGTTCGAAAAGAATAAAGTCGCCTCTTGTTAGAGAGAGACAGAGTGAAGAGAGAGAGAATCTGGTGGGCTTTGAGCTGTGATTTAGCTGTAAGTCTTTTTGGGCGTCTCATTCTCTCTCTCATCACACTTCCAATTTGGCCTCTCACATTCACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988328
ATGAAGCAAAGGAATCGCTGCATTTCGTGGAGCGGTGTCGCGCTGCTGCTGCTAGCTCTGTTCCTCTCTTCCTGCGCCTCCGCTGATGCTTCCGAGGTTCAAATCGGCAGCAATGGCGGCCCGCTCAACGATGCCCAAGTCCGCTACATTACGAAGCGCCAGCTGCTCTACTACCTAGACGAGTTCGGCGACAGAGGCGAGAACGTCGCCGTCGATCCATCGCTCACCTTCGAGAACTCTCGCCTCCGCGACGCCTACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768125.1
MKQRNRCISWSGVALLLLALFLSSCASADASEVQIGSNGGPLNDAQVRYITKRQLLYYLDEFGDRGENVAVDPSLTFENSRLRDAYIALQAWKKAILSDPYNLTADWVGSDVCNYSYVFCAPAPDNSSIRTVAGIDLNHGDIAGYLPEELGLLRDLGIFHINSNRFCGTVPKKFKNLKVLFELDLSNNRFAGKFPYVVLSLPKLIYLDIRFNEFEGTVPPELFDKPLDAIFINHNRFAFELPDNFGNSPVSVIVLANNKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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