当前解析结果
SmilChr06G000795| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000795 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000795 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000795 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 7476117 - 7479126 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988338 |
|---|---|
| GeneID | 130988338 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988338 |
| 原始查询 | LOC130988338 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | MAP kinase kinase kinase, putative (DUF1644) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822188]; symbol=AT3G25910; hit=AT3G25910; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | MAP kinase kinase kinase, putative (DUF1644) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822188]; symbol=AT3G25910; hit=AT3G25910; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G25910 (AT3G25910)MAP kinase kinase kinase, putative (DUF1644) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822188] identity=49.3; qcov=1.05; evalue=2.79e-93; confidence=high |
| Rice | Os01g0612600- identity=44.2; qcov=0.846; evalue=2.46e-69; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07800 (DUF1644) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988338 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768137.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057768137.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057768137.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768137.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768137.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:7478181 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B53,C43,C78 |
Chr6:7478217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A9 |
Chr6:7478302 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr6:7478508 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B10,B113,B24,D10 |
Chr6:7478579 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr6:7478828 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768137.1PF07800
DUF1644 46-234 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768137.1 |
Pfam | PF07800 |
DUF1644 | Family | 46 | 234 | 3.9e-70 | 236.0 | Protein of unknown function (DUF1644) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。