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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000804`

染色体: Chr06 坐标: 7512374-7516441 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000804`
名称	SmilChr06G000804
描述	proline-rich receptor-like protein kinase PERK1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7512374 - 7516441 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988343`
GeneID	`130988343`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988343`
原始查询	`LOC130988343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline-rich receptor-like protein kinase PERK1
产物	proline-rich receptor-like protein kinase PERK1
Arabidopsis	`AT2G18470` (PERK4) roline-rich extensin-like receptor kinase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816362] identity=56.1; qcov=0.866; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0227200` - identity=63.2; qcov=0.894; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988343

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768141.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768141.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768141.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768141.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7512813`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B99,C30
`Chr6:7512813`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B99,C30
`Chr6:7514090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr6:7514332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B57,C43,C83
`Chr6:7514723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:7514842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:7514911`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B24
`Chr6:7514911`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B24
`Chr6:7515699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B40,B93
`Chr6:7515734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B3
`Chr6:7515903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr6:7515921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768141.1

671 aa

336

671

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 304-507 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 307-575 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768141.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	304	507	4.4e-42	145.0	Protein kinase domain
`XP_057768141.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	307	575	4.6e-46	158.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912158.1
CACACTGCTTCAGCGTTCCTCTTGACTTGAAGCTTTCAAATTTACCCCAAACAATACTACTACCGAAAAAAGCAAAATCAATACCACTTTCTTCATCCCTTCATAATCCAACGACTACATTACACTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGAGTTCTGGTCTTAGAGAGGAACCTATACATGTTGCCAAACTTAGCACATTCAAAAACATAAAGATTTTTCAATTTTTCAGCAGAATTCAGACTTGATTCGATTCGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988343
ATGTCGTCGCCGGCGCCGGGGTCCGCCCCCCCTCCCTCTTCGCCTCCTCCTACTAACACAACCGCCCCACCTCCCGCCGCCACCTTACCTCCGCCGCCCACTCCAACGACCACTCCACCACCTACTCCGACGACGGCTCCACCGCCTTCGACTCCGAATCCAAATCCACCAACTACCGCGCCGCCTCCAACCACCGCCTCCCCGCCGCCGGTTCCGGTAGCTCCTCGTCCGTCGACGCCTTCTACTCCGGGAACCCCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768141.1
MSSPAPGSAPPPSSPPPTNTTAPPPAATLPPPPTPTTTPPPTPTTAPPPSTPNPNPPTTAPPPTTASPPPVPVAPRPSTPSTPGTPPPTTSPSPPAPTVPSGSPPSPPAPAGGGAPSPPTRGTPPAPPTRTGSPPGSSGSPPSAPASNDSGISTGMVVGIAVGGVALLVILSLMFICCKKKKRRQQPDYYIPPPPPGYKADPYGGPVQNWQQNVPPPPHHVVAMPPKPTPPPGGASRPPHSPVRAPSPQPPPPPPYMSSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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