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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000837`

染色体: Chr06 坐标: 7883283-7885072 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000837`
名称	SmilChr06G000837
描述	berberine bridge enzyme-like 15
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7883283 - 7885072 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988373`
GeneID	`130988373`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988373`
原始查询	`LOC130988373`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	berberine bridge enzyme-like 15
产物	berberine bridge enzyme-like 15
Arabidopsis	`AT2G34790` (MEE23) FAD-binding Berberine family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818044] identity=59.2; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0549900` - identity=46.3; qcov=0.955; evalue=1.17e-144; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF08031 (BBE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988373

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057768174.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057768174.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057768174.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768174.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7883344`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B115
`Chr6:7883344`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B115
`Chr6:7883345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr6:7883525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,D3
`Chr6:7883532`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C59,D3
`Chr6:7883532`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C59,D3
`Chr6:7883625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:7883651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,B69,B75,C49,C9
`Chr6:7883732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B17,C67
`Chr6:7883758`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B132
`Chr6:7883758`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B132
`Chr6:7883780`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768174.1

532 aa

266

532

FAD_binding_4

BBE

PF01565 FAD_binding_4 78-218 aa PF08031 BBE 471-527 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768174.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	78	218	3.1e-28	98.9	FAD binding domain
`XP_057768174.1`	Pfam	`PF08031`	BBE	Domain	471	527	8.9e-19	67.9	Berberine and berberine like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912191.1
CACTCCTCCATCAACATTCTATAACGAAGCACACCAAAAATGAATCCTCACACCTCATTCATCCTCACTTCATTTCTCCTCCTACTCTCAATCTCAACCGCCGCACCAACTCCAATCCAAGATTCCTTCCCAAAATGCGTATCCAAACACAGCGATAAATCCTCCCCTTCAACCACCACCTTCATCACCGCCGCCCAAGCCTCGCTCTACACCTCCCTTTTGCACTCCACCGCCCAAAACCTCCGATGCCTGCTCCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988373
ATGAATCCTCACACCTCATTCATCCTCACTTCATTTCTCCTCCTACTCTCAATCTCAACCGCCGCACCAACTCCAATCCAAGATTCCTTCCCAAAATGCGTATCCAAACACAGCGATAAATCCTCCCCTTCAACCACCACCTTCATCACCGCCGCCCAAGCCTCGCTCTACACCTCCCTTTTGCACTCCACCGCCCAAAACCTCCGATGCCTGCTCCCCTCCATGCCCAAACCCCTCCTCATCTTCACGCCCACAACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768174.1
MNPHTSFILTSFLLLLSISTAAPTPIQDSFPKCVSKHSDKSSPSTTTFITAAQASLYTSLLHSTAQNLRCLLPSMPKPLLIFTPTTESHVQSAVVCARKLGVHLRLRSGGHDYEGISYTSEFKSPPPFILLDLGKLRAINVDVRSKTAWAQAGATIGELYYRISEKSKTLGFPAGLCTSLGVGGHITGGAYGPMMRKYGLGADNVVDARIVDADGRILDRKSMGEDAFWAIRGGGGGSFGVILAWKVKLVKVPSTVTVFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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