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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000839`

染色体: Chr06 坐标: 7912823-7916177 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000839`
名称	SmilChr06G000839
描述	probable polygalacturonase At1g80170
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7912823 - 7916177 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988375`
GeneID	`130988375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988375`
原始查询	`LOC130988375`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase At1g80170
产物	probable polygalacturonase At1g80170
Arabidopsis	`AT1G80170` (AT1G80170) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844357] identity=45.1; qcov=0.837; evalue=3.53e-84; confidence=high
Rice	`Os05g0542800` (OsPGL9) - identity=40.3; qcov=0.826; evalue=1.02e-77; confidence=medium
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057768178.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057768176.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057768176.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768178.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768178.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7912928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A3,C82
`Chr6:7912930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr6:7912935`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A1,A24,A5,A7,A9,B100,B11,B123,B129,B131,B134,B23,B34,B37,B4,B41,B42,B43,B47,B53,B64,B7,B70,B73,B77,B89,B90,B92,B94,B98,B99,C13,C14,C21,C29,C3,C30,C36,C43,C5,C51,C59,C61,C74,C78,C87,D1,D2,D3
`Chr6:7913538`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A1,A13,A9,B117,B121,B122,B123,B21,B31,B5,B54,B59,B6,B80,B85,B88,B9,C22,C50,C67,C84
`Chr6:7913617`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr6:7913617`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11
`Chr6:7913950`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A18,B140,B40,B70,B71,C62
`Chr6:7914721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B59,C35
`Chr6:7914736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr6:7915391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,B74
`Chr6:7915394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,B74
`Chr6:7915816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768176.1

435 aa

218

435

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 89-419 aa

XP_057768178.1

363 aa

182

363

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 89-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768176.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	89	419	5.9e-81	272.8	Glycosyl hydrolases family 28
`XP_057768178.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	89	358	1.2e-67	229.0	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912193.1
TTGTTTAATTGTTGCATATATGAAAATAGGAGCAGCTTGAACTTGATGGTATGTCGGGAAGATGTGGACGCAGAAACATGGCTTCGCTCTTGAATGCGTTTATGTCAGAAAACATATATATATATCGGATATATGGTGTGTTTGGAGTGTTGTTATTCGTTTTGGCTTCGTCGTCTTCATTAATCCTTACCTGCTGTGGCATCGATGAACCTTATTATTTCAATGTCATCAACTATGGAGCCACCGGAGATGGTTGTACA...

XM_057912195.1
TTGTTTAATTGTTGCATATATGAAAATAGGAGCAGCTTGAACTTGATGGTATGTCGGGAAGATGTGGACGCAGAAACATGGCTTCGCTCTTGAATGCGTTTATGTCAGAAAACATATATATATATCGGATATATGGTGTGTTTGGAGTGTTGTTATTCGTTTTGGCTTCGTCGTCTTCATTAATCCTTACCTGCTGTGGCATCGATGAACCTTATTATTTCAATGTCATCAACTATGGAGCCACCGGAGATGGTTGTACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988375
ATGTCGGGAAGATGTGGACGCAGAAACATGGCTTCGCTCTTGAATGCGTTTATGTCAGAAAACATATATATATATCGGATATATGGTGTGTTTGGAGTGTTGTTATTCGTTTTGGCTTCGTCGTCTTCATTAATCCTTACCTGCTGTGGCATCGATGAACCTTATTATTTCAATGTCATCAACTATGGAGCCACCGGAGATGGTTGTACAGATGATTCACAAGCATTTGCAGAGGCATGGGATGCAGCTTGTAGTTCCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768176.1
MSGRCGRRNMASLLNAFMSENIYIYRIYGVFGVLLFVLASSSSLILTCCGIDEPYYFNVINYGATGDGCTDDSQAFAEAWDAACSSSLESATLYVPPETIFLVDPIIFHGPCNAPIINFLILGTMIAPESPRSWDERDASVWLAFKDMNGLKIDGYGYGVIDGQGKSWWDQSCKYHPHLEECTTLAPTAWKFLGCNESGIRNLKFINSAQTHILLKGCNHFIIQNLIIQSPANTPNTDGIHIQSSHHLLITNSTIACGDD...

XP_057768178.1
MSGRCGRRNMASLLNAFMSENIYIYRIYGVFGVLLFVLASSSSLILTCCGIDEPYYFNVINYGATGDGCTDDSQAFAEAWDAACSSSLESATLYVPPETIFLVDPIIFHGPCNAPIINFLILGTMIAPESPRSWDERDASVWLAFKDMNGLKIDGYGYGVIDGQGKSWWDQSCKYHPHLEECTTLAPTAWKFLGCNESGIRNLKFINSAQTHILLKGCNHFIIQNLIIQSPANTPNTDGIHIQSSHHLLITNSTIACGDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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