当前解析结果
SmilChr06G000845| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000845 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000845 |
| 描述 | uncharacterized protein At2g34160-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 7985661 - 7989188 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988380 |
|---|---|
| GeneID | 130988380 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988380 |
| 原始查询 | LOC130988380 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817977]; symbol=AT2G34160; hit=AT2G34160; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817977]; symbol=AT2G34160; hit=AT2G34160; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G34160 (AT2G34160)Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817977] identity=80.2; qcov=0.938; evalue=5.96e-70; confidence=high |
| Rice | Os06g0602600- identity=81.6; qcov=0.884; evalue=1.43e-65; confidence=high |
| GO | GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01918 (Alba) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988380 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057768181.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057768181.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057768181.1 |
| 4 | Nucleolus | 核仁 | 0.20000 | XP_057768181.1 |
| 5 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057768181.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:7986064 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr6:7986884 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,D7 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768181.1PF01918
Alba 21-80 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768181.1 |
Pfam | PF01918 |
Alba | Domain | 21 | 80 | 6.6e-14 | 52.2 | Alba |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。