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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000852`

染色体: Chr06 坐标: 8071415-8072123 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000852`
名称	SmilChr06G000852
描述	uncharacterized SmilChr06G000852
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8071415 - 8072123 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988385`
GeneID	`130988385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988385`
原始查询	`LOC130988385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem II subunit X [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815210]; symbol=PSBX; hit=AT2G06520; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	photosystem II subunit X [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815210]; symbol=PSBX; hit=AT2G06520; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G06520` (PSBX) photosystem II subunit X [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815210] identity=51.3; qcov=1.04; evalue=1.14e-28; confidence=medium
Rice	`Os07g0673550` (P0470D12.144) - identity=69.6; qcov=0.616; evalue=2.28e-11; confidence=low
GO	GO:0009523 (photosystem II); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06596 (PsbX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768190.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057768190.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057768190.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768190.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768190.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8071644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr6:8071889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B113,B75,C72,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768190.1

112 aa

112

PsbX

PF06596 PsbX 75-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768190.1`	Pfam	`PF06596`	PsbX	Family	75	112	5.5e-15	55.9	Photosystem II reaction centre X protein (PsbX)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912207.1
CGATGTTGCCGAAAATGCCAGCAAATTTAGTGATAATGGCAAGGAGATAACCTTATCCACCTCAACCAAAACCAGAAGCTGCCACGATGGACAAGCTGTGAGATGCCCTCAATTTCCACCTCTCATCCCCTTCTCTCTCCACTCCCACTTCTATTCCTTAATCCTCTAAAAACCAACCCTTATTAATTCATTCGATCACAAACTCAACAACACCAAATACATGGCCTCCACCTCCGCACTTTCCATGGCGGCGCCGGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988385
ATGGCCTCCACCTCCGCACTTTCCATGGCGGCGCCGGTTGCCCAGAACAGGCAACTCGACACATTCTTGAAGCCATTGCCCGTGAGGCCGTCGAGGTTGGTGTCGAAGCCGGCTGTTGGGAAGTTCCAAGTGAGGGCTTCGCTGAAGGAGAAGGCGGTGACGGGGTTGACCGCGGCTGCGCTGACAGCTTCGATTATCCTCCCCGACGTGGCGGAGGCGGCCGTCACTCCGTCTCTCAATAACTTCCTGCTCAGCATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768190.1
MASTSALSMAAPVAQNRQLDTFLKPLPVRPSRLVSKPAVGKFQVRASLKEKAVTGLTAAALTASIILPDVAEAAVTPSLNNFLLSIGAGGVVGLALVGAVIAVSNFDPVKRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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