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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000856`

染色体: Chr06 坐标: 8102256-8106582 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000856`
名称	SmilChr06G000856
描述	protein Brevis radix-like 4
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8102256 - 8106582 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988389`
GeneID	`130988389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988389`
原始查询	`LOC130988389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein Brevis radix-like 4
产物	protein Brevis radix-like 4
Arabidopsis	`AT1G54180` (BRX-LIKE3) BREVIS RADIX-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841858] identity=54; qcov=1.06; evalue=8.15e-117; confidence=high
Rice	`Os09g0444500` (OsBRXL5) - identity=50; qcov=1.27; evalue=7.83e-103; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08381 (BRX); PF13713 (BRX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057768196.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057768196.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768196.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768196.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8102720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:8102724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B13,C72
`Chr6:8102750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B24,B29,B78,C57
`Chr6:8102785`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A18,C29
`Chr6:8102785`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A18,C29
`Chr6:8102925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:8102931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C49
`Chr6:8102952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr6:8102957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:8105902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,C35,C64,C66,C81
`Chr6:8106211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768196.1

334 aa

167

334

BRX_N

BRX

PF13713 BRX_N 32-62 aa PF08381 BRX 137-191 aa PF08381 BRX 278-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768196.1`	Pfam	`PF13713`	BRX_N	Domain	32	62	1e-11	45.0	Transcription factor BRX N-terminal domain
`XP_057768196.1`	Pfam	`PF08381`	BRX	Domain	137	191	1.3e-53	178.9	Transcription factor regulating root and shoot growth via Pin3
`XP_057768196.1`	Pfam	`PF08381`	BRX	Domain	278	333	1.3e-53	178.9	Transcription factor regulating root and shoot growth via Pin3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912213.1
AATTAATATGAACAGGAATCAATGTGGTGGCGTAATTTAAGGGAGGGCATTAATACGGTGGTCTGATCAACACGCCATACCTCATAACCCCTTCAAGCCTAAACTCTCATTTTCCATTTGATTACAAGAAAGGAGTATATCTCTGCTGTACATATAGTTGCAGTTGCAGAGGGGAAAATGCTTACATGCATTGCACGTTCGAAGCAGTCGAGCAATGACGCGTCGCCGGCCGTCGATCTTCCCCCGCCGGAAAAACATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988389
ATGCTTACATGCATTGCACGTTCGAAGCAGTCGAGCAATGACGCGTCGCCGGCCGTCGATCTTCCCCCGCCGGAAAAACATAACTCCAATGCTACTCCGACCAAACAAGCCATCAAAATCCTCTCCTCTCAGATCAAGGATATGGCGCTGAAGGCGTCGGGCGCGTACCGCCAGTGCGCGCCATTCGCCGCTCAAACGACGCCGCATCAGCGGCGGAACGGTAGCTGCGGCGGCGGCGAGTCGGACTCAGACAGATTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768196.1
MLTCIARSKQSSNDASPAVDLPPPEKHNSNATPTKQAIKILSSQIKDMALKASGAYRQCAPFAAQTTPHQRRNGSCGGGESDSDRFRWSYRRAGSSGSNSSSALGRRQLEARLKGTPASASGRRVDPVVFVEESEPKEWVAQVEPGVLITFLSLPRGGNDLKQIKFSREMFNKWQAQRWWTENCEKVTELYNVQRLNRQAFPLPGDDTATKMESVEHSPVTPPLGRDGAGAVASSSSDSLEQHSVQSIVSTGTTAKTEAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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