当前解析结果
SmilChr01G000783| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000783 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000783 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000783 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 17046258 - 17047118 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988403 |
|---|---|
| GeneID | 130988403 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988403 |
| 原始查询 | LOC130988403 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=31.3; qcov=0.916; evalue=4.99e-30; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988403 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057768241.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057768241.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057768241.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057768241.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768241.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:17046363 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr1:17046365 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C22,C71 |
Chr1:17046386 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A19,B106,B15,B63,C7 |
Chr1:17046388 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr1:17046392 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B114,C85 |
Chr1:17046420 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,C71,C73 |
Chr1:17046425 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,A22,B21 |
Chr1:17046434 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B66,C26 |
Chr1:17046440 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,B37 |
Chr1:17046446 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B69 |
Chr1:17046455 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B51,C41 |
Chr1:17046458 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。