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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000871`

染色体: Chr06 坐标: 8234139-8237204 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000871`
名称	SmilChr06G000871
描述	UBP1-associated proteins 1C
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8234139 - 8237204 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988405`
GeneID	`130988405`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988405`
原始查询	`LOC130988405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UBP1-associated proteins 1C
产物	UBP1-associated proteins 1C
Arabidopsis	`AT2G19385` (AT2G19385) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816457] identity=49.8; qcov=0.997; evalue=8.47e-87; confidence=high
Rice	`Os01g0583200` - identity=45.2; qcov=1.06; evalue=1.69e-77; confidence=high
GO	GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0003677 (DNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF08790 (zf-LYAR); PF12874 (zf-met); PF25879 (WHD_LYAR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988405

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768211.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057768211.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768211.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768211.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8234336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:8234562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:8236070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr6:8236109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B136,C84
`Chr6:8236185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C85
`Chr6:8236421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C85
`Chr6:8236866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C54,C64,C66
`Chr6:8236903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C85
`Chr6:8236914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768211.1

324 aa

162

324

zf-LYAR

zf-met

WHD_LYAR

PF08790 zf-LYAR 30-57 aa PF12874 zf-met 95-119 aa PF25879 WHD_LYAR 252-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768211.1`	Pfam	`PF08790`	zf-LYAR	Domain	30	57	8.7e-14	51.8	LYAR-type C2HC zinc finger
`XP_057768211.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	95	119	2e-05	25.4	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057768211.1`	Pfam	`PF25879`	WHD_LYAR	Domain	252	322	5.9e-28	97.9	LYAR family winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912228.1
AAATTCCCTAATATTCACCAATTCTGAAAAACCCTAGACAAAACCCCCCCAAATTTGAAGGCCTGCCTAATCCCACTCGCATAGCATTTCTTGTTACAGAGCTGAACTAGTCTACACCCACAGAGCACGCAGTGGATGTGAGAAGAGATGGTCTGGTTTCAGTGTGAGGACTGCGGCGACAACCTTAAGAAACCCAAGCTTCCTAATCACTTCAGGCAATGCTCTGCTTTCAAGCTATCGTGTATCGATTGTGGACAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988405
ATGGTCTGGTTTCAGTGTGAGGACTGCGGCGACAACCTTAAGAAACCCAAGCTTCCTAATCACTTCAGGCAATGCTCTGCTTTCAAGCTATCGTGTATCGATTGTGGACAAGTATTTGGGCAGCAAGACGTTGAAAGCCATACTCAATGCATTACCGAAGCGGAAAAATACGGTCCAAAGGGTCAAGGAAATGCAGTGAATGGAATGAACACTAAGCCCAAAAAAGATGCAAAGCTGAAACCAGAGGTTGACATAAATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768211.1
MVWFQCEDCGDNLKKPKLPNHFRQCSAFKLSCIDCGQVFGQQDVESHTQCITEAEKYGPKGQGNAVNGMNTKPKKDAKLKPEVDINVGLSERPPWFCSLCNTKATSKQALLLHADGRKHRAKARGFHAKQQGNGTVETNGSAENNATNIVPENKDLGDSRDINSSKVAPLCDGSGVENNSLDSNKKRKLEASENGDANHKSGVDVSIELGNGKVSQIQGAQTEVTKSSKKAKLSAKEEHTKLDSAADKDECKSIKWKKLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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