当前解析结果
SmilChr06G000872| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000872 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000872 |
| 描述 | 60S ribosomal protein L18a-like protein |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 8241384 - 8244353 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988406 |
|---|---|
| GeneID | 130988406 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988406 |
| 原始查询 | LOC130988406 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 60S ribosomal protein L18a-like protein |
| 产物 | 60S ribosomal protein L18a-like protein |
| Arabidopsis | AT4G26060 (AT4G26060)Ribosomal protein L18ae family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828712] identity=71.4; qcov=0.892; evalue=5.37e-45; confidence=medium |
| Rice | Os01g0183633- identity=67.7; qcov=0.637; evalue=2.92e-29; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988406 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.60000 | XP_057768212.1 |
| 2 | Endosome | 内体 | 0.60000 | XP_057768213.1 |
| 3 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.60000 | XP_057768212.1 |
| 4 | Endosome membrane | 内体膜 | 0.40000 | XP_057768212.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057768212.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:8241771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B61 |
Chr6:8242079 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。