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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000881`

染色体: Chr06 坐标: 8373926-8375613 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000881`
名称	SmilChr06G000881
描述	protein ALP1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8373926 - 8375613 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988416`
GeneID	`130988416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988416`
原始查询	`LOC130988416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALP1-like
产物	protein ALP1-like
Arabidopsis	`AT5G12010` (AT5G12010) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831074] identity=68.6; qcov=0.782; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0582600` (B1097D05.32) - identity=68.4; qcov=0.725; evalue=3.25e-178; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768221.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768221.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768221.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768221.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768221.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8374020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr6:8374197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:8374322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C9
`Chr6:8374349`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B79,C74
`Chr6:8374349`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B79,C74
`Chr6:8374374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:8374419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C49,C9
`Chr6:8374498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr6:8374630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:8374674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:8374827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B88,C16,C52
`Chr6:8374923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768221.1

472 aa

236

472

DDE_Tnp_4

PF13359 DDE_Tnp_4 261-418 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768221.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	261	418	1.3e-32	113.4	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912238.1
ACTCCGCTTCCCAACCCTCCTCGAATATTCCTCACCGCGTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCCGCGTTCAATTTTCTCCCATATATATATACGCCTATTTCATTTCCTCTCCTCCTCATCAAAACACTCTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCAGTAAGACATTTCATCAAACACCTTCCAATCGCTGCAATTTTAATGGAAATCTCGTCATTCGACTTCTCATTCGTCCAGGATTCCGACCCCAGCTTCATCTCCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988416
ATGGAAATCTCGTCATTCGACTTCTCATTCGTCCAGGATTCCGACCCCAGCTTCATCTCCTTCTCCAACGCCAAGAAGCGCCCCAGATTCGACAACGATTCCTCCCTCGAAGATGTCCTCACCAATCTGCTAGCATTCGACGCCTCCGCCGCCGTCGAAGAAACACCCTCCTACACAGCGCCGCCGCAGACTTCATTTTACATGAATTCCACCTCTAACTACAACCAACAAACCCCCGACAGCTCCAACGGCTACCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768221.1
MEISSFDFSFVQDSDPSFISFSNAKKRPRFDNDSSLEDVLTNLLAFDASAAVEETPSYTAPPQTSFYMNSTSNYNQQTPDSSNGYPNSSPSRNSPQPKRARAEATATTSDDSSSGGAVNGGRRLWVKSRSKAWWELVDSPNYPEEDFQKEFRMSKATFDMICDELDSAVNKKDTMLRTAIPVRQRVAVCIWRLATGEALREVSKRFGLGISTCHKLVLEVCTAIRTVLMPKFLQWPDDKRMHQIKNEFEVFSGIPNVGGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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