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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000894`

染色体: Chr06 坐标: 8445897-8449875 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000894`
名称	SmilChr06G000894
描述	uncharacterized SmilChr06G000894
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8445897 - 8449875 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988427`
GeneID	`130988427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988427`
原始查询	`LOC130988427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsDjC55; symbol=OsDjC55; hit=Os06g0535300; species=rice; confidence=medium
产物	OsDjC55; symbol=OsDjC55; hit=Os06g0535300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G27240` (AT5G27240) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832782] identity=33.3; qcov=1.05; evalue=9.86e-113; confidence=low
Rice	`Os06g0535300` (OsDjC55) - identity=37.8; qcov=0.976; evalue=8.2e-136; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF11926 (DUF3444)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768239.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768239.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768239.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768239.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8446323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B136,B37,B90,B92
`Chr6:8446467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:8446540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:8446793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B106,B7
`Chr6:8446841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:8447202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:8447220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:8447366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr6:8447515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84
`Chr6:8447527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:8447585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr6:8447729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768239.1

748 aa

374

748

DnaJ

DUF3444

PF00226 DnaJ 67-128 aa PF11926 DUF3444 481-686 aa

XP_057768240.1

748 aa

374

748

DnaJ

DUF3444

PF00226 DnaJ 67-128 aa PF11926 DUF3444 481-686 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768239.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	67	128	1.5e-20	73.7	DnaJ domain
`XP_057768239.1`	Pfam	`PF11926`	DUF3444	Family	481	686	3.6e-77	259.4	Domain of unknown function (DUF3444)
`XP_057768240.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	67	128	1.5e-20	73.7	DnaJ domain
`XP_057768240.1`	Pfam	`PF11926`	DUF3444	Family	481	686	3.6e-77	259.4	Domain of unknown function (DUF3444)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912256.1
TTCTTTGTGGCTCTTTCTCTTCCAAATGAAATACATGAAATTTTGGGACAAATGAAATTTGAGAAGAATTCAGGGTCCCTTCACTCTCTTCTCTCTCTTTTGTGCTTTCCCCAAATTTTCACTCTTCAATTTCCCTCCACTTTTTTCCCTCCGTTTTGCTCCCGATCTTTACAAAAATCTTTTAAACCTCTCTCTACCTGTCCATCCCTTTCTCCCTCCATCTTCAAACTGCTTTTTCTTTCAATTCGCGGAACAGACTA...

XM_057912257.1
CTCTTCCAAATGAAATACATGAAATTTTGGGACAAATGAAATTTGAGAAGAATTCAGGGTCCCTTCACTCTCTTCTCTCTCTTTTGTGCTTTCCCCAAATTTTCACTCTTCAATTTCCCTCCACTTTTTTCCCTCCGTTTTGCTCCCGATCTTTACAAAAATCTTTTAAACCTCTCTCTACCTGTCCATCCCTTTCTCCCTCCATCTTCAAACTGCTTTTTCTTTCAATTCGCGGAACAGACTAAGGTTCAGGTACAGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988427
ATGGAGTGCAACAAAGATGAGGCTGTCCGGGTCAGGGAACTGGCGGAGATGAAAATGAAAAACAATGACTTTGAAGGGGCTCGAAAGAATGTACTGAAGGCACAGAATCTTTATCCAGAACTTGAGAATATTTCCCAGCTGCTTAGCATCTGTGATGTTCATTGTTCAGCTAAAAGATTGGTGCCTGGATCTGAAAAGGACTGGTATGGAGTCCTTCAAGTTGCAAAGTTTGCTGATGAGATGGCAATCAAGAAACAATA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768239.1
MECNKDEAVRVRELAEMKMKNNDFEGARKNVLKAQNLYPELENISQLLSICDVHCSAKRLVPGSEKDWYGVLQVAKFADEMAIKKQYRRLALFLHPDKNRFPGAESAFKLICEANAVLSDPQKKYLYDQKIRVMVRSTPVVPPHHHLNKTSQFNKQYGPEIKVANGFRSMNQHQTTQSSFSVRQEVFCTSCPFCSLKYQLDRKFVNKNLRCQKCTKTFTGYETGAQGIPEGVPLASKYAPGSSQNGIPNHGGSKHGVQNG...

XP_057768240.1
MECNKDEAVRVRELAEMKMKNNDFEGARKNVLKAQNLYPELENISQLLSICDVHCSAKRLVPGSEKDWYGVLQVAKFADEMAIKKQYRRLALFLHPDKNRFPGAESAFKLICEANAVLSDPQKKYLYDQKIRVMVRSTPVVPPHHHLNKTSQFNKQYGPEIKVANGFRSMNQHQTTQSSFSVRQEVFCTSCPFCSLKYQLDRKFVNKNLRCQKCTKTFTGYETGAQGIPEGVPLASKYAPGSSQNGIPNHGGSKHGVQNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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