当前解析结果
SmilChr01G002950| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002950 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002950 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002950 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 48373487 - 48376455 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988450 |
|---|---|
| GeneID | 130988450 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988450 |
| 原始查询 | LOC130988450 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988450 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768286.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057768286.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768286.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768286.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057768286.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:48373707 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B38,B71 |
Chr1:48373718 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C3,C65,D8 |
Chr1:48373719 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B59,B63,B78 |
Chr1:48375916 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A3,B26,B59,B86,C10,C13,C29,C33,C45,C74,C77 |
Chr1:48375927 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B34,B37,B68,C47 |
Chr1:48375928 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B34,B37,B68,C47 |
Chr1:48375944 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B76,C28,C35 |
Chr1:48375955 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,B21 |
Chr1:48375957 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B21,C13,C18,C36 |
Chr1:48375959 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
Chr1:48375970 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B21 |
Chr1:48375995 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。