当前解析结果
SmilChr06G000927| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000927 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000927 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000927 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 8799251 - 8804583 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988461 |
|---|---|
| GeneID | 130988461 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988461 |
| 原始查询 | LOC130988461 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | RING finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835034]; symbol=AT5G49710; hit=AT5G49710; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | RING finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835034]; symbol=AT5G49710; hit=AT5G49710; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G49710 (AT5G49710)RING finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835034] identity=58.6; qcov=0.965; evalue=2.4e-86; confidence=high |
| Rice | Os02g0781700 (OJ1369_G08.12-2)- identity=51.9; qcov=1.04; evalue=9.79e-72; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988461 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.80000 | XP_057768303.1 |
| 2 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.80000 | XP_057768303.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057768303.1 |
| 4 | Lipid droplet | 脂滴 | 0.40000 | XP_057768303.1 |
| 5 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057768303.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:8802053 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:8802114 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C87,D2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。