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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000941`

染色体: Chr06 坐标: 9032293-9034094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000941`
名称	SmilChr06G000941
描述	uncharacterized SmilChr06G000941
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9032293 - 9034094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988473`
GeneID	`130988473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988473`
原始查询	`LOC130988473`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=26.8; qcov=0.51; evalue=5.79e-07; confidence=low
Rice	`Os04g0590366` - identity=27.7; qcov=0.997; evalue=2.83e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768317.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768317.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768317.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768317.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768317.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9032872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B23,B46,B6,C48
`Chr6:9032875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B23,B46,B6,C48
`Chr6:9033252`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B57
`Chr6:9033252`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B57
`Chr6:9033442`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B101,B96,C39,C55,D4,D5
`Chr6:9033511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C46,C8
`Chr6:9033512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B131,B53,D5
`Chr6:9033528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B110,B125,C63
`Chr6:9033529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C77,D9
`Chr6:9033562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B73
`Chr6:9033569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B135,B76,C46,C8
`Chr6:9033571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C29,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768317.1

308 aa

154

308

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 25-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768317.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	25	120	1.8e-05	26.3	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912334.1
AAAAATTACAAGAGTGCCTATCACTTATCAAATCACCTTTCCATTTACCAAATCATCGCAGATTCACGCAGATGAAAATTTTGGCGGGTTTTCCCAATTTCTCCATCTTCCTCAAGCTATGGCTCTAATCTCTGCGTGACCCCATTTTCAAGCAGCGAAATTGTTGAAGTTTACCAAAATCGCTCACATCCCTACTACTCTCCTCTGGAAATTTGGCACCGGTGCTCTCGATTTCGTTCGACATGAGTTCTACCCAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988473
ATGAGTTCTACCCAAGAAGCTAGTGGCGGAGATGGAGGCAAGGCTAACAAAACCGATAAGACCAGACGTATTTGGTCCCCACGCGAGGAAGACATCCTTATTGCAGCGCTTAAAGAACTGGTAGCTCAAGGATGGAAATCAGACAATGGGTTTCGAGGTGGGTATCTTAAGAAGCTTGAAGACACGATGAAAAGAGAGTTTCCTGGGACGGACCTAAAAGGAACACCTCATATCAATTCTAAGCTGTGTACGTGGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768317.1
MSSTQEASGGDGGKANKTDKTRRIWSPREEDILIAALKELVAQGWKSDNGFRGGYLKKLEDTMKREFPGTDLKGTPHINSKLCTWKKNYNSLIEILKPSGVGFNLKGTFMIDIDNHQWDEVLKKDNNARNMRYKPWPYLDDWKEIFGKDRATGQSAEDIFDALGKLPRDDNLEEDGIDSEFRALDEQVETENGENSSIGQQAEQVCKSKSKKRKSGDGLENLYALIGDIGRETASRMDMMCSRIGYDHDLAKARKDAFEC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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