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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000959`

染色体: Chr06 坐标: 9245258-9247027 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000959`
名称	SmilChr06G000959
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 20-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9245258 - 9247027 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988484`
GeneID	`130988484`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988484`
原始查询	`LOC130988484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 20-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 20-like
Arabidopsis	`AT4G29190` (OZF2) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829040] identity=55; qcov=1.07; evalue=1.4e-116; confidence=high
Rice	`Os01g0192000` (DOS) - identity=48.4; qcov=1.01; evalue=8.29e-95; confidence=high
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00642 (zf-CCCH); PF25512 (zf-CCCH_AtC3H23)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988484

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768333.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057768333.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057768333.1`
4	P-body	P-body	0.20000	`XP_057768333.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768333.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9246110`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A14
`Chr6:9246110`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A14
`Chr6:9246119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr6:9246593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768333.1

349 aa

174

349

zf-CCCH_AtC3H23

zf-CCCH

PF25512 zf-CCCH_AtC3H23 91-124 aa PF00642 zf-CCCH 135-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768333.1`	Pfam	`PF25512`	zf-CCCH_AtC3H23	Domain	91	124	3.3e-23	81.8	AtC3H23-like, CCCH zinc finger
`XP_057768333.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	135	156	3.3e-07	30.8	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912350.1
CGCCCTCTCGCCGTCGGTTAAAAAACTAATTGCTAAAAATTTAACCCCCATAATAACCTCGGTGACTCGCTGTCCACCCACAATTCATCACAACCCAATCAAATCTAGGTAAACTACACGTGTCGATATCACGTTTCGCCTTCGTACTTTAGTCCACGAATGATGCCGTATTGAAGAATACCCCACTTCTTTAACCGAGAATTTTCACCTACGCATGGTTCGGTCATTTCCTAACCATGGTTAAACACCAGGAGCAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988484
ATGATGCTTGGAGAGAGAAGCTATGGCGGTACGACGGTGCATACTCCTCCGTGGCCCTCCGCCGCAGACGATCACAGCTCCCTCGCCTTGAGCCCCACCGCCGTCAATGCTAACGGCAACGTCGACGACTACTCTTTATTCTTCCAGGCCGACTCCTTAAAGGCGCTGCAGCGTTACTTACCGTCCAACTCAACCGACGTCGTTCCGGAGTTCTCCTTTGCTGACTCGGATGGCAGCGATTTCCTCCCCGTGGACGCGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768333.1
MMLGERSYGGTTVHTPPWPSAADDHSSLALSPTAVNANGNVDDYSLFFQADSLKALQRYLPSNSTDVVPEFSFADSDGSDFLPVDAHSCDNFRMFEFKVRKCTRGRSHDWTECPFAHPGEKARRRDPRKYHYSGTACPDFRKGTCRKGDACEFSHGVFECWLHPARYRTQPCKDGVSCKRRVCFFAHAPEQLRVLSPRADSYDGSASSSHSRFPFIASPESPSPPAAESPPMSPTVNEMVASLRQLQLNKVKSMPSSWLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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