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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000960`

染色体: Chr06 坐标: 9272632-9277502 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000960`
名称	SmilChr06G000960
描述	DNA-directed RNA polymerase 2A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9272632 - 9277502 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988500`
GeneID	`130988500`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988500`
原始查询	`LOC130988500`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase 2A-like
产物	DNA-directed RNA polymerase 2A-like
Arabidopsis	`AT5G15700` (AT5G15700) DNA/RNA polymerases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831424] identity=87.5; qcov=0.752; evalue=3.22e-50; confidence=medium
Rice	`Os09g0246200` (OsRpoTm) - identity=86.3; qcov=0.812; evalue=6.88e-55; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0006390 (mitochondrial transcription); GO:0034245 (mitochondrial DNA-directed RNA polymerase complex)
KEGG	-
Pfam	PF00940 (RNA_pol)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988500

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057768362.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057768362.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057768362.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768362.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768362.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9274602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr6:9274625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr6:9274668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B63,B67,B73,C33,C34,C54,C57,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768362.1

117 aa

117

RNA_pol

PF00940 RNA_pol 17-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768362.1`	Pfam	`PF00940`	RNA_pol	Family	17	103	6.3e-44	151.2	DNA-dependent RNA polymerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090115.1
GTGGTTATGGCAGCTTAATGGTCTTAGTTGACTTGGTGAATTTGCCTTTTTGGTTGTTTGTGGTGGCCTTTGAGTTATATTACATATGGTTGTGGTTCTACTTCTTGATGAATGAAGATTTTAAGATAGACCACTTGAAGGAGAGCGTTGGTGGTTAAAAGCAGAAGATCCTTTTCAATGTTTGGCAGCATGCATTAACCTTGCTGAGGCCCTTAGAAGTCCATCTCCCGAGACAATAATATCTCATATTCCAGTCCACC...

XM_057912379.1
TCTTTGCGATCTCTCCCTAGAGATAGTCGTCGCCGCTGCCGAGCCAAGTTCCGGCGAATGGTAGCTATTCGCACTCTTCCGGCGACATCGGTCGCCGCGACCTCGCCTCTCCATTTTCCTCTAACATATAGTTAGGGCAAAGGTCGAGCCCTAGTTCTTCTCTGTTCGGTACAACCCAGCCGTCGCCATCTCAGGGAGACCGGCGAGCTGCGCGACCTAGAGCCCGCCCATCGTTGTTGGTGGTCCGAGGATCGGCGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988500
ATGATGACGAGAACACTGATACTTCTACTGAGAATTTTGGAGATTGATGCAGATAGACCACTTGAAGGAGAGCGTTGGTGGTTAAAAGCAGAAGATCCTTTTCAATGTTTGGCAGCATGCATTAACCTTGCTGAGGCCCTTAGAAGTCCATCTCCCGAGACAATAATATCTCATATTCCAGTCCACCAAGATGGTTCTTGCAATGGTTTACAGCATTATGCTGCCCTTGGTAGGGATAAGCCAGGGGCAGCTGCTGTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768362.1
MMTRTLILLLRILEIDADRPLEGERWWLKAEDPFQCLAACINLAEALRSPSPETIISHIPVHQDGSCNGLQHYAALGRDKPGAAAVNLVAGEKPADVYSGIATRDVTFKKGGRSRWR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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