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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000994`

染色体: Chr06 坐标: 9815265-9818645 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000994`
名称	SmilChr06G000994
描述	ATP-dependent 6-phosphofructokinase 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9815265 - 9818645 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988528`
GeneID	`130988528`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988528`
原始查询	`LOC130988528`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent 6-phosphofructokinase 1-like
产物	ATP-dependent 6-phosphofructokinase 1-like
Arabidopsis	`AT4G26270` (PFK3) phosphofructokinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828733] identity=81.8; qcov=0.902; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0191700` (OsPFK01) - identity=79; qcov=0.896; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003872 (6-phosphofructokinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006002 (fructose 6-phosphate metabolic process); GO:0006096 (glycolytic process)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00030 (Pentose phosphate pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00365 (PFK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988528

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057768392.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057768390.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057768390.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057768390.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768392.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9815960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B139,B32,C4,C48
`Chr6:9816122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:9816977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:9817038`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr6:9817038`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr6:9817045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D2
`Chr6:9818178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B8,B89,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768390.1

528 aa

264

528

PFK

PF00365 PFK 151-463 aa

XP_057768391.1

519 aa

260

519

PFK

PF00365 PFK 151-454 aa

XP_057768392.1

508 aa

254

508

PFK

PF00365 PFK 131-443 aa

XP_057768393.1

499 aa

250

499

PFK

PF00365 PFK 131-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768390.1`	Pfam	`PF00365`	PFK	Domain	151	463	3e-59	201.4	Phosphofructokinase
`XP_057768391.1`	Pfam	`PF00365`	PFK	Domain	151	454	6.7e-62	210.1	Phosphofructokinase
`XP_057768392.1`	Pfam	`PF00365`	PFK	Domain	131	443	2.7e-59	201.5	Phosphofructokinase
`XP_057768393.1`	Pfam	`PF00365`	PFK	Domain	131	434	6.2e-62	210.2	Phosphofructokinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912407.1
TAGCCGGTCCAGCAATCAGACGTTGTACCCTGCGGTAAGAAGATTGGACATTACCGGACAACTGCTGAAATAAAGCCGTTTTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCAGCGCTCCACTCCAAATTTCCGTGAACATCTATCCGAAATCTCTGCCAACTGTTTTTTCTCTCTCGTTCCACGCAGAAATAACTCGACAAGATCAAGATTTGAATATCATCAACAAGATTAAAGAGGAAACTTGGGCCAGGCGCAA...

XM_057912409.1
AGCCGGTCCAGCAATCAGACGTTGTACCCTGCGGTAAGAAGATTGGACATTACCGGACAACTGCTGAAATAAAGCCGTTTTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCAGCGCTCCACTCCAAATTTCCGTGAACATCTATCCGAAATCTCTGCCAACTGTTTTTTCTCTCTCGTTCCACGCAGAAATAACTCGACAAGATCAAGATTTGAATATCATCAACAAGATTAAAGAGGAAACTTGGGCCAGGCGCAAC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130988528
ATGGGATCGATGTCTACTGGTGTTGGCGCTGCCATCGCGCCCGCAGCCACGGCGGCGTTGATGCTGCGGCCCGGCAGCGCGGAGGCGGACGGCGGCGATCACAGCTTGAAGAAGAAACTCTCTTGTCCGAATTCGGGAAACGGCTTCTCGAAGCTTCTTCCGTCGATGGGATTGGAGATCAATAACAGCAAGCCCAAAATACTCACCGGTGAATTTGGTTACACTCTCGAGGATGTCCCTCACCTCTCTGACTACATCCC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057768390.1
MGSMSTGVGAAIAPAATAALMLRPGSAEADGGDHSLKKKLSCPNSGNGFSKLLPSMGLEINNSKPKILTGEFGYTLEDVPHLSDYIPHLPTYPNPLQDNPAYAAVRQFFVDYDDTVAEKIVVHKDTVRGVHFRRAGPRQRVYFECDDVQACIVTCGGLCPGLNTVIREIVCGLNHMYGVKSVLGIDGGYRGFYSKNTISLTPKSVNDIHKRGGTVLGTSRGGYDTKKIVDSIQDRGINQVYIIGGDGTQKGAAVIFEEIR...

XP_057768391.1
MGSMSTGVGAAIAPAATAALMLRPGSAEADGGDHSLKKKLSCPNSGNGFSKLLPSMGLEINNSKPKILTGEFGYTLEDVPHLSDYIPHLPTYPNPLQDNPAYAAVRQFFVDYDDTVAEKIVVHKDTVRGVHFRRAGPRQRVYFECDDVQACIVTCGGLCPGLNTVIREIVCGLNHMYGVKSVLGIDGGYRGFYSKNTISLTPKSVNDIHKRGGTVLGTSRGGYDTKKIVDSIQDRGINQVYIIGGDGTQKGAAVIFEEIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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