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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000997`

染色体: Chr06 坐标: 9834666-9840780 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000997`
名称	SmilChr06G000997
描述	mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9834666 - 9840780 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988531`
GeneID	`130988531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988531`
原始查询	`LOC130988531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-like
产物	mitochondrial-processing peptidase subunit alpha-like
Arabidopsis	`AT1G51980` (AT1G51980) Insulinase (Peptidase family M16) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841627] identity=63.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0739000` - identity=65.3; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006508 (proteolysis); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00675 (Peptidase_M16); PF05193 (Peptidase_M16_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768396.1`
2	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057768396.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057768396.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057768396.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768396.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9835792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:9835838`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B39
`Chr6:9835838`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B39
`Chr6:9835926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B32,C14
`Chr6:9837126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:9839034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:9840029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C42
`Chr6:9840311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768396.1

502 aa

251

502

Peptidase_M16

Peptidase_M16_C

PF00675 Peptidase_M16 85-228 aa PF05193 Peptidase_M16_C 237-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768396.1`	Pfam	`PF00675`	Peptidase_M16	Family	85	228	1.8e-40	138.9	Insulinase (Peptidase family M16)
`XP_057768396.1`	Pfam	`PF05193`	Peptidase_M16_C	Domain	237	420	1.5e-27	97.4	Peptidase M16 inactive domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912413.1
TAACATTTCCCACGGGCCACTGCCGAATGCTCAGCCCAATACTTCCTTGTATAAGGCCCGGCCCGAAGCAAGAAAAAACCCATATTACTCGTTCGTGTGAAGCGCACGTGACGGAATCCTGGTTGGGCCGCCGTCGTCTCTCTTTACTTGTATCTCTCGTCGTCTCCTCTGCCAATCGCATACCCTTCCACACAGACCAACGCATCCACCGTCAAATCTCGCTATGTACAGAACGGCCGCGTCAAGAGTTAGGTCTCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988531
ATGTACAGAACGGCCGCGTCAAGAGTTAGGTCTCTCAAGCGCCTGACAGGTTCTAGGGGATGGGCTGGATATGCAAGTACTGTTGCTGCAACCCAGTCATCGTCTGGAAGTCTCTTCAGTTGGTTGACGGGTGAGCAGTCATCCTCACTTTCACCTCTAGACTTCCCCTTAAAGGATGTTACTCTTCCCTCTCCACTACCAGACTATGTTGAGCCTGGAAAAACTAGGATAACCACTCTTGCAAATGGTCTCAGAATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768396.1
MYRTAASRVRSLKRLTGSRGWAGYASTVAATQSSSGSLFSWLTGEQSSSLSPLDFPLKDVTLPSPLPDYVEPGKTRITTLANGLRIASETSATPVASIGLHVDCGSIYETPDSFGATHLLERMAFKSTLNRSHLRIVREVEAIGGNVSASGSREHISYTYDALKTYVPQMVELLIDCVRNPAFLDWEVSEQLHKVSDDISESSKNPHHLLVEAIHSTGYSGPYANALLASESGVNHLNSTVLEKFLSENYTASRMVLAAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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