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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001001`

染色体: Chr06 坐标: 9905283-9907721 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001001`
名称	SmilChr06G001001
描述	laccase-17-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9905283 - 9907721 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988536`
GeneID	`130988536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988536`
原始查询	`LOC130988536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-17-like
产物	laccase-17-like
Arabidopsis	`AT5G60020` (LAC17) laccase 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836124] identity=74; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0842500` (OsLAC5) - identity=72.4; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057768400.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057768400.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768400.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768400.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9905528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B15,B84,C71
`Chr6:9905631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr6:9905840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C37
`Chr6:9905879`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A7
`Chr6:9905879`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A7
`Chr6:9906141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B7,C42,C9
`Chr6:9906226`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B14,C79
`Chr6:9906226`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B14,C79
`Chr6:9906244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:9906256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:9906283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:9906308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B82,C35,C64,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768400.1

573 aa

286

573

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 37-150 aa PF00394 Cu-oxidase 163-313 aa PF07731 Cu-oxidase_2 431-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768400.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	37	150	3.3e-41	140.8	Multicopper oxidase
`XP_057768400.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	163	313	4.6e-44	151.0	Multicopper oxidase
`XP_057768400.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	431	555	4.2e-40	137.4	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912417.1
CATATATACATAAATCCACAGTTACTGTTAGCCTTTACAAAAAAAGGAAAAATGGGTAGCCCTCAATTAGTTGCATGTATAGCACTGTTTTGTGCATTGATGGCGTTGTGCCTGCTTCCTCACCATGCAAATGCCATCACCAGGCGCTTCGACTTCAATATCAAAATGCAAAATGTAACACGATTATGCCACACGAAGAGCATGGTGACTGTGAACGGGAAATTCCCAGGGCCTCGTGTAGTAGCAAGGGAGGGAGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988536
ATGGGTAGCCCTCAATTAGTTGCATGTATAGCACTGTTTTGTGCATTGATGGCGTTGTGCCTGCTTCCTCACCATGCAAATGCCATCACCAGGCGCTTCGACTTCAATATCAAAATGCAAAATGTAACACGATTATGCCACACGAAGAGCATGGTGACTGTGAACGGGAAATTCCCAGGGCCTCGTGTAGTAGCAAGGGAGGGAGATCGCCTACTCATAAAAGTCACCAATCATGTCCCCAACAATATCACCATCCACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768400.1
MGSPQLVACIALFCALMALCLLPHHANAITRRFDFNIKMQNVTRLCHTKSMVTVNGKFPGPRVVAREGDRLLIKVTNHVPNNITIHWHGIRQLRSGWADGPAYITQCPIKXAQTYVYNFTLVGQRGTLFWHAHISWLRATLYGPIIILPKINVDYPFQKPYKEIPIIFGEWFNADPEAIIKQALASGGGPNVSDAYTINGLPGPLYNCSAKDTFKLKVKAGKTYLLRIINAALNDELFFSIANHTLTVVDVDAVYVKPFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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