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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001003`

染色体: Chr06 坐标: 9925384-9937482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001003`
名称	SmilChr06G001003
描述	acid phosphatase 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9925384 - 9937482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988538`
GeneID	`130988538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988538`
原始查询	`LOC130988538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acid phosphatase 1-like
产物	acid phosphatase 1-like
Arabidopsis	`AT5G51260` (AT5G51260) HAD superfamily, subfamily IIIB acid phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835200] identity=49; qcov=0.984; evalue=6.07e-87; confidence=high
Rice	`Os06g0139800` - identity=53.8; qcov=0.926; evalue=1.35e-87; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03767 (Acid_phosphat_B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057768403.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057768403.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768403.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768403.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9929478`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr6:9929478`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr6:9929497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768403.1

257 aa

128

257

Acid_phosphat_B

PF03767 Acid_phosphat_B 37-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768403.1`	Pfam	`PF03767`	Acid_phosphat_B	Family	37	256	2e-76	257.2	HAD superfamily, subfamily IIIB (Acid phosphatase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912420.1
GGGATTACATCACTGCCATTTTTCTATATTGGAGTAATTATTACGATGATGATGATTGTAGAAAGTAGGAAAAAGGAAATGAATCAGGCGGCGGCAGAGCGATCGGAGAAGTCTGAAGCTAGCCTGGAAGCTATGGCAGAGTGGTACATGGTCTCATGAAACGACGACGCATCGCAAGTCATCTTCCGGAACTGCCTGGCTTTCTCCTCCGTGAAACACCCGGGAGCCAACCGGGTTTTTGCTGCTGGCTTCCACTCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988538
ATGGCGTTCATCCAATGGGGCCTGATTACGCTCATCGTGATCCTCTGCGCTGGGCCCACTTGGTCGGCCCCATCGATCATTCAGATAACGCCGGAAAAGGAGACCGACCGCCGCCGAGCTGACGACCTGTACTGCAGCAGCTGGCGGTTCACGGTGGAGACAAACGACGCCGGCGCCTGGACGCGGGTGCCGCCGAGGTGCGTCGATTTCGTGAAGGAGTACATCACCGGCGACCTCTACAGCTCGGAGCTGGAGGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768403.1
MAFIQWGLITLIVILCAGPTWSAPSIIQITPEKETDRRRADDLYCSSWRFTVETNDAGAWTRVPPRCVDFVKEYITGDLYSSELEAVAANSEAYARAIGVSGDGRDAWVFDIDETLLSNVPYYAVHGFGSEIFDEPSFDEWVELAEAPAIVPGLRLYKELQELGFTIFLLTGRGEYQRHATERNLMYAGFTSWQKLILRGNSDKGKPASVFKSEKRKEIEDAGYIIHGSSGDQWSDLMGFAVARRSFKLPNPLYYIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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