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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001013`

染色体: Chr06 坐标: 10009036-10009863 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001013`
名称	SmilChr06G001013
描述	protein OXIDATIVE STRESS 3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10009036 - 10009863 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988547`
GeneID	`130988547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988547`
原始查询	`LOC130988547`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OXIDATIVE STRESS 3-like
产物	protein OXIDATIVE STRESS 3-like
Arabidopsis	`AT5G56550` (OXS3) oxidative stress 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835756] identity=49.4; qcov=0.604; evalue=6.28e-16; confidence=low
Rice	`Os02g0684400` - identity=41; qcov=0.873; evalue=4.91e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30470 (OXS3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768412.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768412.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768412.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768412.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10009136`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	64	A15,A19,A22,A6,B100,B101,B106,B11,B110,B126,B129,B13,B15,B16,B17,B18,B2,B24,B29,B35,B41,B44,B47,B53,B61,B64,B82,B84,B9,B90,B92,B98,C10,C14,C16,C18,C19,C21,C27,C34,C35,C38,C39,C41,C44,C46,C5,C52,C55,C56,C59,C60,C63,C64,C66,C71,C73,C74,C75,C8,C81,C82,C87,D1
`Chr6:10009239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C27,C82
`Chr6:10009277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768412.1

134 aa

134

OXS3

PF30470 OXS3 14-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768412.1`	Pfam	`PF30470`	OXS3	Family	14	91	1.3e-09	38.8	Oxidative stress 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912429.1
CAAAAATCAACCTTATCCTCTTTTCATTTCCTTGCACAATGGGAAAGGTAAATAATTCAAACACTATGAAAACGACCGCTCCTCTCTTCTTCTACGTGGCAAGGATCATTTCTAACCCTAATCCCCCTTCAATTACACCCACACATATATCATATTATCTCTCTCCACTATAAACAATTAATAATTGCAGCCGCATATCCTCTCTCTCTCTCTTAATTCCTTCGTAAATCAGAAAGCGTATATATATGCATTGTTTGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988547
ATGGAAATGGAATTGGAAAGGTCTAGGCAAGTGAGGTGGGCAGATATGAAGAAAGATGAGAATTGTAAATCCATGGAGTCTTTGAGTGATTCAGAGGCATCATCATCTTCATCTGAAGACGCAACAACCTCTTCACTCTTTGAATTCGCCGACCTCATGGCTCAACTGCCCATCAAGAGGGGTCTGTCCAAGTACTATGAGGGAAAATCGGAGAGTTTTGCGTCGTTGACGAGTGTGGAGAGTGTTGAAGATCTGGCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768412.1
MEMELERSRQVRWADMKKDENCKSMESLSDSEASSSSSEDATTSSLFEFADLMAQLPIKRGLSKYYEGKSESFASLTSVESVEDLAKKEKRMKSCKSYGSNLNRHKFRPKATITKRSSPPLTFSPKPTNTMVVN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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