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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001034`

染色体: Chr06 坐标: 10267852-10269762 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001034`
名称	SmilChr06G001034
描述	oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10267852 - 10269762 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988568`
GeneID	`130988568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988568`
原始查询	`LOC130988568`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic
产物	oxygen-evolving enhancer protein 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G50820` (PSBO2) photosystem II subunit O-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824246] identity=77.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0501800` (PsbO) - identity=83.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0010207 (photosystem II assembly); GO:0010242 (oxygen evolving activity); GO:0042549 (photosystem II stabilization)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01716 (MSP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768435.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057768435.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057768435.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768435.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768435.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10268179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10268479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:10268608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768435.1

328 aa

164

328

MSP

PF01716 MSP 95-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768435.1`	Pfam	`PF01716`	MSP	Family	95	327	7.2e-99	330.6	Manganese-stabilising protein / photosystem II polypeptide

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912452.1
ATGGGCCAAATATATATGTATTTATTTTTATTTTAAAAATCTATATCCTAAATAATTACAAATCTTTATCCTAAATAAAAGAATGTCCACGTGAGACACAGGTTAAGTTGAACCAATGAAAGAAGGGCTTATCCTATCTCTTTATCTTGGCAACACAACACACTGATACAAAATCCATTTCCGCAGAGTGGCACCACTAATCAACAAACACCACAAAATCATGGCAACGTCATCGTTACAGGCGGCTGCCACCTTCATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988568
ATGGCAACGTCATCGTTACAGGCGGCTGCCACCTTCATGCAGCCCACCAAGGTTGGCCGGAGCAGCGGCGGCATCCTCCAGTTCCGCCCCGCCCAAGGCGTAGGCAAGGCCTTCGGCGTCGAGCCCTCCGCCGCCAGATTGACTTGCTCTCTTCAGGATTTTGCTCAGAAATGCACCGACGCTGCAAAGATCGCTGGCTTTGCTCTCGCAACCTCAGCCCTCGTCGTCTCGGGAGCAAATGCGGAAGGCGTGCCGAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768435.1
MATSSLQAAATFMQPTKVGRSSGGILQFRPAQGVGKAFGVEPSAARLTCSLQDFAQKCTDAAKIAGFALATSALVVSGANAEGVPKRLTFDEIQSKTYLEVKGTGTANQCPTIDGGVDGFAFKAGKYNTKKLCLEPTSFTVKAEGVSKNSPAEFQKTKLMTRLTYTLDEIEGPLEVSGDGTLKFEEKDGIDYAAVTVQLPGGERVPFLFTIKNLVASGKPESFSGEFLVPSYRGSSFLDPKGRGGSTGYDNAVALPAGGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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