当前解析结果
SmilChr06G001048| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001048 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001048 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001048 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 10348854 - 10350723 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988576 |
|---|---|
| GeneID | 130988576 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988576 |
| 原始查询 | LOC130988576 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate-2, 6-diaminopimelate ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829863]; symbol=AT4G37090; hit=AT4G37090; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate-2, 6-diaminopimelate ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829863]; symbol=AT4G37090; hit=AT4G37090; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G37090 (AT4G37090)UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate-2, 6-diaminopimelate ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829863] identity=46.8; qcov=1.02; evalue=3.42e-36; confidence=medium |
| Rice | Os02g0186700- identity=43.3; qcov=1.06; evalue=1.4e-29; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988576 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768441.1 |
| 2 | Nucleolus | 核仁 | 1.00000 | XP_057768441.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768441.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768441.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057768441.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:10349894 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B2,C17,D11 |
Chr6:10350152 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:10350401 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C37,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。