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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001099`

染色体: Chr06 坐标: 10995059-11009151 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001099`
名称	SmilChr06G001099
描述	UPF0496 protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10995059 - 11009151 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988618`
GeneID	`130988618`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988618`
原始查询	`LOC130988618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein 1-like
产物	UPF0496 protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G34320` (AT4G34320) transmembrane protein, putative (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829582] identity=50.4; qcov=0.899; evalue=3.32e-118; confidence=high
Rice	`Os03g0199100` - identity=51.7; qcov=0.958; evalue=1.78e-122; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677); PF05633 (ROH1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988618

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768490.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057768490.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768490.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768490.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768490.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11006093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C86
`Chr6:11006094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C22,C86
`Chr6:11006099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr6:11006109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:11006113`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A1,A13,A20,A7,A9,B107,B121,B122,B123,B129,B131,B135,B137,B139,B14,B15,B21,B22,B23,B29,B31,B32,B47,B5,B51,B52,B54,B55,B56,B59,B6,B68,B71,B85,B86,B9,B90,B92,B96,C13,C2,C25,C36,C48,C50,C57,C58,C59,C60,C62,C67,C73,C75,C84,D1
`Chr6:11007965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C86
`Chr6:11008252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C7
`Chr6:11008253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B45,B54,C85
`Chr6:11008297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B54,C32
`Chr6:11008306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B29
`Chr6:11008319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B45,B54,C85
`Chr6:11008326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768490.1

404 aa

202

404

ROH1-like

DUF677

PF05633 ROH1-like 54-168 aa PF05055 DUF677 55-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768490.1`	Pfam	`PF05633`	ROH1-like	Family	54	168	0.00014	21.7	Protein ROH1-like
`XP_057768490.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	55	382	4.2e-106	355.4	Protein of unknown function (DUF677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090153.1
TTTTTTCAACTATACACAAAATAGGATACCAATAAACTTTCTTCTCAAAAAAAAGTAGACAAATAAAGTTCATGTCACAGTCAACTCTTACAATCATTTCCGACATATTTATGGCATTAGATCACCAACAATAAGCCGCTAATTAAAAAATGGGCGCACAAATGAGCCGAACGTTCCGCCGCGCCGGCAGCCTCCGTCCGCCGGCGGCGGCTGAGCCACCTGCTGCAAATCATGACCTCAACTCCTCCAATTCTGCTTCC...

XM_057912507.1
TTTTTTCAACTATACACAAAATAGGATACCAATAAACTTTCTTCTCAAAAAAAAGTAGACAAATAAAGTTCATGTCACAGTCAACTCTTACAATCATTTCCGACATATTTATGGCATTAGATCACCAACAATAAGCCGCTAATTAAAAAATGGGCGCACAAATGAGCCGAACGTTCCGCCGCGCCGGCAGCCTCCGTCCGCCGGCGGCGGCTGAGCCACCTGCTGCAAATCATGACCTCAACTCCTCCAATTCTGCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988618
ATGGGCGCACAAATGAGCCGAACGTTCCGCCGCGCCGGCAGCCTCCGTCCGCCGGCGGCGGCTGAGCCACCTGCTGCAAATCATGACCTCAACTCCTCCAATTCTGCTTCCGCTGACTCCGACCTGAGCTCGTACGAAGCGGCGTGCCGCTCCGACCCCGACCTCCAAAACTTCGACTCGAAGCTCCAGATCCGCACAAGCCGCGCCATCAACTCCATCTCCGTGGGCCTCGACGCCCGCTCCCTCCCCCTCGACTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768490.1
MGAQMSRTFRRAGSLRPPAAAEPPAANHDLNSSNSASADSDLSSYEAACRSDPDLQNFDSKLQIRTSRAINSISVGLDARSLPLDSLREVTEYLLEMNQEVVTIILQNKRDIWKDDEFSDLVDDYFENSLLTLDFCTSLDSCLKRAARIESVVNVALRKFDDERANAGRNYSRTLAELGNFSAAEEPFTQEFFKVFARVYAKQASMLERLQAKKQNLDRKLGKLQAWRKVSNVIFVVTFAAVLVCSVVAAAVSAPPVVTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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