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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001122`

染色体: Chr06 坐标: 11288426-11289879 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001122`
名称	SmilChr06G001122
描述	uncharacterized SmilChr06G001122
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11288426 - 11289879 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988642`
GeneID	`130988642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988642`
原始查询	`LOC130988642`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842644]; symbol=AT1G63380; hit=AT1G63380; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842644]; symbol=AT1G63380; hit=AT1G63380; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G63380` (AT1G63380) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842644] identity=56; qcov=1; evalue=1.6e-117; confidence=high
Rice	`Os08g0510400` - identity=56.8; qcov=0.961; evalue=4.54e-101; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057768520.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768520.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768520.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768520.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768520.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11288619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,C35,C64,C66,C81
`Chr6:11288641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr6:11288678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr6:11288701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B2
`Chr6:11288705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr6:11288719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr6:11288732`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A1,A7,A9,B10,B111,B117,B123,B129,B14,B140,B22,B23,B29,B31,B47,B5,B54,B56,B59,B6,B68,B85,B86,B90,B92,C13,C15,C2,C36,C50,C57,C59,C60,C62,C67,C73,C75,D1
`Chr6:11288748`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A16
`Chr6:11288748`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A16
`Chr6:11288797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A16,A21,B101,B111,B117,B28,B3,B33,B35,C27,C31,C56,C65,C70,C80,C83,D5
`Chr6:11288809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:11288811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768520.1

284 aa

142

284

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 18-221 aa PF08659 KR 20-188 aa PF13561 adh_short_C2 24-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768520.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	18	221	2.4e-49	168.2	short chain dehydrogenase
`XP_057768520.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	20	188	1.1e-08	35.9	KR domain
`XP_057768520.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	24	272	2.5e-42	145.8	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912537.1
CCTAAACCCTCCTATCAAAAACAAAATGACGACTAAAATCCCTCACCAATTGGAGCCATGGTCTCAACTCAAGGACAAAATCGTCATGATCACCGGCGCCTCCTCCGGTATTGGCCTCGAGTTCTGCGTTGACCTCGCCAAGGCCGGCTGTAGAATCGTCGCCGCCGCACGTAGAATCAATAATCTCAACTCTCTTTGTGATCAAATAAACAAAGTAGACGTCCCGACTGACGTTTCGTGTCGAGCTCTCGCGGTGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988642
ATGACGACTAAAATCCCTCACCAATTGGAGCCATGGTCTCAACTCAAGGACAAAATCGTCATGATCACCGGCGCCTCCTCCGGTATTGGCCTCGAGTTCTGCGTTGACCTCGCCAAGGCCGGCTGTAGAATCGTCGCCGCCGCACGTAGAATCAATAATCTCAACTCTCTTTGTGATCAAATAAACAAAGTAGACGTCCCGACTGACGTTTCGTGTCGAGCTCTCGCGGTGGAGCTCGATGTCACGGCCGACGGCCCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768520.1
MTTKIPHQLEPWSQLKDKIVMITGASSGIGLEFCVDLAKAGCRIVAAARRINNLNSLCDQINKVDVPTDVSCRALAVELDVTADGPTICECVDKAWDAFGRIDVLINNAGVNGIKATSIEMSEEEWENVVKTNFKGSWLLSKYVGARMRDSGRGGSIINISSVFGLNRTQYRGSLAYSSSKSGLDSMTKVMALELGDYNIRVNSIAPSLFRSAMTESLFRQSNYKLVKNMVENSVPLRTHGTINPALTSVVRYLIHDSSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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