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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001131`

染色体: Chr06 坐标: 11356286-11358333 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001131`
名称	SmilChr06G001131
描述	proline dehydrogenase 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11356286 - 11358333 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988651`
GeneID	`130988651`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988651`
原始查询	`LOC130988651`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proline dehydrogenase 2, mitochondrial-like
产物	proline dehydrogenase 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G38710` (AT5G38710) Methylenetetrahydrofolate reductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833862] identity=55; qcov=0.913; evalue=1.5e-173; confidence=high
Rice	`Os10g0550900` (OsProDH) - identity=44.7; qcov=0.896; evalue=2.68e-120; confidence=medium
GO	GO:0004657 (proline dehydrogenase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0010133 (GO:0010133); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01619 (Pro_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988651

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768530.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057768530.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057768530.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057768530.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11356403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:11356517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr6:11356663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:11356674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B77,C23
`Chr6:11356785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:11356786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:11357613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B39
`Chr6:11358069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768530.1

482 aa

241

482

Pro_dh

PF01619 Pro_dh 126-460 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768530.1`	Pfam	`PF01619`	Pro_dh	Family	126	460	6.7e-66	223.4	Proline dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912547.1
CAAAACTGAATACAAGATCCTCTATTACACATCTGTTCACAGCTTAAGTGCCAAAGTCCCAATAACCTATTCACAAAGAATTAGCAAAATTCTAAACCTTTCAGTCAATTCTTCATGGCAACCCGCAGCAGCACTAACATCCCAAAACTTATAGCCAAGCTTCCCCACTACTGCCGCCGCCTCAAGTCCTCAGCCGCTGCCTCCTTAGCCTCCTCCGGGCAACCCGTAAACGTTCCTAAACCGGAAGAGTCGCCCTACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988651
ATGGCAACCCGCAGCAGCACTAACATCCCAAAACTTATAGCCAAGCTTCCCCACTACTGCCGCCGCCTCAAGTCCTCAGCCGCTGCCTCCTTAGCCTCCTCCGGGCAACCCGTAAACGTTCCTAAACCGGAAGAGTCGCCCTACATCAATCTGGATGACTCCAAGAAGCTCTTCTCATCGGTCCCAACGGCAAAGCTGATGGTATCCACATTCACTCTTCATGTGGTGATGAATGAACTCATGATCGATATAGGCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768530.1
MATRSSTNIPKLIAKLPHYCRRLKSSAAASLASSGQPVNVPKPEESPYINLDDSKKLFSSVPTAKLMVSTFTLHVVMNELMIDIGSKVMNSRLMKSPVLRELLLRSIEHTLYHHFCGGKTLREADQAARKLWESGLQAMLDYGMEHAHDNASCNQNVQEIIETIASTISLPSSPVSSVVVKITAIFPPRLLKRVSDLLRWEYKDKSLHLPWKLQSFPLLSDSSALYHTPEMPGALTLDEERDLELGFGRLMKICESSLEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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