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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001153`

染色体: Chr06 坐标: 11665521-11668520 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001153`
名称	SmilChr06G001153
描述	probable galacturonosyltransferase 9
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11665521 - 11668520 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988670`
GeneID	`130988670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988670`
原始查询	`LOC130988670`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galacturonosyltransferase 9
产物	probable galacturonosyltransferase 9
Arabidopsis	`AT3G02350` (GAUT9) galacturonosyltransferase 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820474] identity=73.8; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0498700` - identity=68.1; qcov=0.743; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0047262 (polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057768558.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057768558.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768558.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768558.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768558.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11665896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B8,B89,C10
`Chr6:11665952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:11666751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C61
`Chr6:11667089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C52
`Chr6:11667110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B112,C73,C79
`Chr6:11667335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:11667600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,B95
`Chr6:11667633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:11667854`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A25,B110,B121,B42,B43,B45,B60,B62,B75,C50,C72,D3,D4,D6
`Chr6:11668074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768558.1

590 aa

295

590

Glyco_transf_8

PF01501 Glyco_transf_8 216-469 aa PF01501 Glyco_transf_8 499-564 aa

XP_057768561.1

557 aa

278

557

Glyco_transf_8

PF01501 Glyco_transf_8 216-531 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768558.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	216	469	6.4e-71	239.6	Glycosyl transferase family 8
`XP_057768558.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	499	564	6.4e-71	239.6	Glycosyl transferase family 8
`XP_057768561.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	216	531	2.9e-78	263.7	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912575.1
GATGAAGTATTTGATAACTACCCAATCACATGTGAAACCGGAGACAATGAAAGTGCAATACATTAAATCGAATACAGTAATCACCGACGCCGAAACGCGGGTCGGACCACTATCTTTCTCTCTCTCCTACTCCTCACAGCGAACTGCCAGATCTTACTTCTCTTCTCCCTCACTATCACTATCTCTCTCATACGCACACACCGCCGATTTGACCAACAACACACACAACACTGATTCGCGTGTATCTATATCCGCGCTCA...

XM_057912578.1
GATGAAGTATTTGATAACTACCCAATCACATGTGAAACCGGAGACAATGAAAGTGCAATACATTAAATCGAATACAGTAATCACCGACGCCGAAACGCGGGTCGGACCACTATCTTTCTCTCTCTCCTACTCCTCACAGCGAACTGCCAGATCTTACTTCTCTTCTCCCTCACTATCACTATCTCTCTCATACGCACACACCGCCGATTTGACCAACAACACACACAACACTGATTCGCGTGTATCTATATCCGCGCTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988670
ATGGCTGTGGCGGTCCGGGGCAATCGAGTCGGATCGAGCGGCGGATCCGTCCTCCGCAGCTTCTTCAGCTACCGGATCTTCGTTTCCGCTATGTTCACGCTCCTTTTCCTCGCTACTCTCTCCGTCCTCCTCACATCTCACCCATCTCACAACGATTCCGTTGTGGATGCTTCAGGGAATGCACATGTAAGACGAAGTTTTCTAGCGTGGCAGTCAGATCCGGTGAAGACTAGGTTAGATTTGATATATAACCAGGCAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768558.1
MAVAVRGNRVGSSGGSVLRSFFSYRIFVSAMFTLLFLATLSVLLTSHPSHNDSVVDASGNAHVRRSFLAWQSDPVKTRLDLIYNQANNHIALVNAYATYARKLKLEISKQLKMFDDLAQNFSDLQLKQTYRTALFESDGPVDEDVLRQFEKEVKDKVKIARLMIAENKESYDNQLKIQKLKDTIFAVNELLVKAKKNGVFASLIAAKSTPKSLHCLAMRLMEERIAHPEKYVDDEPGPELEDPNLYHYALFSDNVIAISV...

XP_057768561.1
MAVAVRGNRVGSSGGSVLRSFFSYRIFVSAMFTLLFLATLSVLLTSHPSHNDSVVDASGNAHVRRSFLAWQSDPVKTRLDLIYNQANNHIALVNAYATYARKLKLEISKQLKMFDDLAQNFSDLQLKQTYRTALFESDGPVDEDVLRQFEKEVKDKVKIARLMIAENKESYDNQLKIQKLKDTIFAVNELLVKAKKNGVFASLIAAKSTPKSLHCLAMRLMEERIAHPEKYVDDEPGPELEDPNLYHYALFSDNVIAISV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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