当前解析结果
SmilChr06G001173| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001173 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001173 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001173 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 11949720 - 11951513 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988695 |
|---|---|
| GeneID | 130988695 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988695 |
| 原始查询 | LOC130988695 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988695 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768591.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768591.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768591.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057768591.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057768591.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:11950648 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr6:11950654 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B46,C16,C37,D7 |
Chr6:11950654 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B46,C16,C37,D7 |
Chr6:11950720 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B118,B22,B48,B86,C73 |
Chr6:11950726 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,C46,C59 |
Chr6:11950760 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C8 |
Chr6:11950775 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,C48 |
Chr6:11950787 |
AAC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B75,D11 |
Chr6:11950787 |
AAC |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B75,D11 |
Chr6:11950797 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B123,B55,C37,D11 |
Chr6:11950798 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr6:11950799 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B12,B123,B55,C37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。