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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001180`

染色体: Chr06 坐标: 12001693-12005542 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001180`
名称	SmilChr06G001180
描述	protein LONGIFOLIA 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12001693 - 12005542 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988698`
GeneID	`130988698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988698`
原始查询	`LOC130988698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LONGIFOLIA 1-like
产物	protein LONGIFOLIA 1-like
Arabidopsis	`AT1G74160` (TRM4) LONGIFOLIA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843756] identity=28.4; qcov=1.18; evalue=5.82e-63; confidence=low
Rice	`Os03g0418700` (OSJNBb0028K20.10) - identity=25.1; qcov=1.1; evalue=5.25e-38; confidence=low
GO	GO:0051513 (regulation of monopolar cell growth)
KEGG	-
Pfam	PF14309 (DUF4378)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057768601.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057768601.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057768601.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12002277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B32,B91,C86
`Chr6:12002474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,D1
`Chr6:12002631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr6:12002680`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr6:12002680`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr6:12002766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B32,B91,C86
`Chr6:12002796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr6:12002875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B46
`Chr6:12002875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:12003005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:12003066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr6:12003246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768601.1

900 aa

450

900

DUF4378

PF14309 DUF4378 780-896 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768601.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	780	896	1e-14	56.0	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912618.1
ATGGTGAAAACTTCAGATGGAAATGAAGATGTGCTGCCGAGGCAGATTGGGTGCATCAACGGCATATTTCAGCTCTTCAATCATCGCCTCTTTTTCGTTGGTCGGAGTTTTGGGAGCCACCCACGCAAGAGGCTACTAATAGGTTCCCAACAACAATTGGAGCCTCGTAATGCAACAAAAGCAGTCATAGCGAAAGATCCGGATTTGCAGAAGGGAAGAACACGAGAGTCCTCGGAATCACCAGAAGCCTCCTCTCCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988698
ATGGTGAAAACTTCAGATGGAAATGAAGATGTGCTGCCGAGGCAGATTGGGTGCATCAACGGCATATTTCAGCTCTTCAATCATCGCCTCTTTTTCGTTGGTCGGAGTTTTGGGAGCCACCCACGCAAGAGGCTACTAATAGGTTCCCAACAACAATTGGAGCCTCGTAATGCAACAAAAGCAGTCATAGCGAAAGATCCGGATTTGCAGAAGGGAAGAACACGAGAGTCCTCGGAATCACCAGAAGCCTCCTCTCCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768601.1
MVKTSDGNEDVLPRQIGCINGIFQLFNHRLFFVGRSFGSHPRKRLLIGSQQQLEPRNATKAVIAKDPDLQKGRTRESSESPEASSPSSSHSSTHSSMTGQKHLLNRGLESSDIRGLVKDSMYREARGMKHVDSPRPLQRSKGAKDILPRFSYDGTGRETHDAVKTNTKLKENPRFSLDSKASSLIHSALESRLNSLCCKVPPVTKESGSHSRSSSIVTKLMGLDDFPNSIITDESSTASPKVAFLSKPPTAAERRQLKQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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