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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001187`

染色体: Chr06 坐标: 12081317-12083249 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001187`
名称	SmilChr06G001187
描述	40S ribosomal protein S19-3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12081317 - 12083249 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988705`
GeneID	`130988705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988705`
原始查询	`LOC130988705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S19-3-like
产物	40S ribosomal protein S19-3-like
Arabidopsis	`AT5G61170` (AT5G61170) Ribosomal protein S19e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836238] identity=86.2; qcov=0.952; evalue=1.44e-88; confidence=high
Rice	`Os03g0424800` (RPS19A) - identity=75.2; qcov=0.972; evalue=1.35e-79; confidence=high
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01090 (Ribosomal_S19e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768610.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057768610.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12081620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B137,C6,C84
`Chr6:12081655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:12081669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr6:12081677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B115,C55,C57
`Chr6:12081832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B24,C26,C56
`Chr6:12081845`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A15,A22,B107,B113,B120,B43,B51,B75,C34,C35,C39,C41,C62,C68
`Chr6:12081909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B91,C86
`Chr6:12081916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B52,B96,C62
`Chr6:12081949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:12081985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr6:12083060`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C56
`Chr6:12083060`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768610.1

145 aa

145

Ribosomal_S19e

PF01090 Ribosomal_S19e 7-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768610.1`	Pfam	`PF01090`	Ribosomal_S19e	Family	7	140	5.5e-57	192.1	Ribosomal protein S19e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912627.1
GGGATAAAGCCCAAAGAATGAGTGTTGACGAAACGGGCTATGGTCCATCAAAACCATTTATGTATGTATATATATTCGCGCAGCAATAGCCTCGTAAACCCTAACCATTCTGCTCCACCGCTGCTGCTTTTCGGCCATCTCTCTATTTCGGCGGACAGGTGAGCTGCACGGTTTCCGGAAATATGGCGGCGACGGCGAAAACTGTTAAGGATGTTTCTCCTCATGAGTTCGTCAAAGCTTACGCCGCTCACCTCAAGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988705
ATGGCGGCGACGGCGAAAACTGTTAAGGATGTTTCTCCTCATGAGTTCGTCAAAGCTTACGCCGCTCACCTCAAGCGGTCCGGCAAGATGGAGCTTCCTGAGTGGACTGACATTGTGAAAACTGGTGTCCTCAAAGAACTTGCTCCTTATGATCCCGACTGGTACTACATCAGGGCCGCTTCCATGGCTAGGAAGATATACCTCAGGGGAGGTATTGGTGTTGGCTCCTTCAGAAGAATTTATGGAGGGAGCAAGAGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768610.1
MAATAKTVKDVSPHEFVKAYAAHLKRSGKMELPEWTDIVKTGVLKELAPYDPDWYYIRAASMARKIYLRGGIGVGSFRRIYGGSKRNGSRPPHFGKSSGSVARHILQQLQNMNIVEMEPRGGRRITSNGRRDLDQVSGRIVVVAP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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