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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001204`

染色体: Chr06 坐标: 12317667-12320733 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001204`
名称	SmilChr06G001204
描述	F-box/LRR-repeat/kelch-repeat protein At2g27520-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12317667 - 12320733 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988722`
GeneID	`130988722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988722`
原始查询	`LOC130988722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat/kelch-repeat protein At2g27520-like
产物	F-box/LRR-repeat/kelch-repeat protein At2g27520-like
Arabidopsis	`AT2G27520` (AT2G27520) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817298] identity=25.7; qcov=0.755; evalue=3.5e-08; confidence=low
Rice	`Os09g0448100` (OsFbox489) - identity=29.2; qcov=0.428; evalue=5.94e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057768633.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768633.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057768633.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12317941`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A16,A21,A7,B111,B112,B13,B28,B33,B42,B43,B49,B55,B70,B79,B85,B94,C16,C33,C45,C52,C58,C64,C66,C83,D3,D5
`Chr6:12317970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B77
`Chr6:12318022`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C5
`Chr6:12318022`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C5
`Chr6:12318031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr6:12318411`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A10,B119,B30,B36,B4,B72,B81,C42
`Chr6:12318485`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A1,A10,B100,B103,B108,B140,B21,B22,B24,B37,B50,B57,B65,B73,B81,B83,C30,C36,C44,C59,C79
`Chr6:12318565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:12318629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:12318643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:12318648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A15,B9,C38
`Chr6:12318648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768633.1

376 aa

188

376

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 18-248 aa PF07734 FBA_1 52-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768633.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	18	248	6.4e-18	65.5	F-box associated beta propeller domain
`XP_057768633.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	52	203	3.3e-20	73.0	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912650.1
AACGGAGAAGATTATAGAATAAAGGGATTTTCAGAAATTTGGTTGGCATTACTAAAGCTTCGATTCTGAGCTTTTAATCGACACTTTATCTTCTTCACGAGAAATTTCTCGTCTAAGCTTCTTCTTCATTACGAATGGATGATGAGCTTGTTGTGAAATCTTTTAACGGCGATGGCGATAATGAGCATTATTTATCTAGTATTTCTCCCCAAGACATGCCTTGGAAGGAAGGATTTGAAAATTTCAATCTTTATTTTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988722
ATGGATGATGAGCTTGTTGTGAAATCTTTTAACGGCGATGGCGATAATGAGCATTATTTATCTAGTATTTCTCCCCAAGACATGCCTTGGAAGGAAGGATTTGAAAATTTCAATCTTTATTTTTATGGTAAAGAAAGAGTTTCTGGTAATATTTGTGGTGGGCTGTTGTATTTGGATGATTTTGATGGCAAAAGTGTTGTGTGCAACTTAACAACTAAAGAGTTCAAATTTCTTCCTGCGCCCAAGAAAACCTCTCCGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768633.1
MDDELVVKSFNGDGDNEHYLSSISPQDMPWKEGFENFNLYFYGKERVSGNICGGLLYLDDFDGKSVVCNLTTKEFKFLPAPKKTSPCWDNFHGSGLGFDSKSGDYKVIRSYTRCKCDPEDENDREGCRGGSHTKTELYSLQSDSWKEIPNPDAHTFPDCGVYIMGKCYWAVASEDGSSFSILSFDFSDESFSCIPSPPVSEKKFMYDLVECHGLLGAIVYEYKIPKHSKRGAKSYQLWVWKESWWAKSFGVALRGIESPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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