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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001209`

染色体: Chr06 坐标: 12380509-12386062 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001209`
名称	SmilChr06G001209
描述	ninja-family protein AFP3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12380509 - 12386062 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988726`
GeneID	`130988726`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988726`
原始查询	`LOC130988726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ninja-family protein AFP3-like
产物	ninja-family protein AFP3-like
Arabidopsis	`AT3G29575` (AFP3) ABI five binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822619] identity=40.4; qcov=0.966; evalue=1.17e-47; confidence=medium
Rice	`Os03g0419100` - identity=68.6; qcov=0.265; evalue=4.76e-30; confidence=weak
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0007165 (signal transduction); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF07897 (EAR); PF16135 (TDBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988726

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768642.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768642.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768642.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768642.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768642.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12380716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B90,B92,C17
`Chr6:12380827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:12385286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:12385399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr6:12385444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:12385446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C43,C6
`Chr6:12385447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C43,C6
`Chr6:12385460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:12385509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:12385675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A19,B18,C16,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768642.1

264 aa

132

264

EAR

TDBD

PF07897 EAR 34-68 aa PF16135 TDBD 224-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768642.1`	Pfam	`PF07897`	EAR	Family	34	68	5.3e-13	49.1	Ethylene-responsive binding factor-associated repression
`XP_057768642.1`	Pfam	`PF16135`	TDBD	Domain	224	257	4.2e-07	30.6	Tify domain binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912659.1
AGTTATATAAAGTACTTGTCCAGTGGCTTTTCCCCTTTAAACTCGTTTTCACTTTCTCTCCTCTTTTGCCGGCCGTTAATCTTCTGTCTGAAAACCCCTAAAATTCTCATAATCCGCGTTCTAGTTTTTTGCTACCAAACACGGCATTGATGTTTCTTCTGGGACGAGCAGCCTCCAAGATTTGTAGCAGCAGTCCAAAGTTTATGACCAATTTCTTCAAATTCTTCACTTCGGATTTCCCGGGAAAAGAATTGTGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988726
ATGGAGGGAGACGAAGACAACACGCGTCGATTTCTAGGGGCGGACGGAACTTCAAAAGATCCGATGCACAAGTCGGCGAAGCGGACTGAGAGAGAAAGAGAGGAGAAGGAGGAATTGGAGCTGAGCTTGGGGCTTTCCACCAACGGCAGATTCGGTGTCGACCTCGCGAGCAAGAAGATGAGACGCTCCTCTTCCGTCTCCAACATAGTGTTGTTGAATATTGATTGTGCAGGAGATGACCAGGCGCGTGGGGCGGACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768642.1
MEGDEDNTRRFLGADGTSKDPMHKSAKRTEREREEKEELELSLGLSTNGRFGVDLASKKMRRSSSVSNIVLLNIDCAGDDQARGADAPLARTCSLPPAFDSGGRTRTRMEKLKSVDGGDGVHADAGLNADMARDGIRNLRLKEWPKPPIESRGDHSHIVKGATQTTMTGSSCSGGGPTVLVANTDEAQQQNALVDMPYVSTKGFGPNHNKIEGFLYRYKRGEEVKIVCVCHGMFLSPAEFVKHGGGGDVAYPLKHIVVNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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