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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001214`

染色体: Chr06 坐标: 12470395-12473138 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001214`
名称	SmilChr06G001214
描述	uncharacterized SmilChr06G001214
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12470395 - 12473138 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988731`
GeneID	`130988731`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988731`
原始查询	`LOC130988731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0211400; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0211400; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G15430` (AT5G15430) Plant calmodulin-binding protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831395] identity=54; qcov=0.104; evalue=6.89e-08; confidence=weak
Rice	`Os03g0211400` - identity=67.9; qcov=0.11; evalue=1.17e-11; confidence=weak
GO	GO:0005516 (calmodulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF07839 (CaM_binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988731

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057768652.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057768652.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057768652.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057768652.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768652.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12470815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:12470830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:12470849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:12470932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B9,C37,C38
`Chr6:12470996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38
`Chr6:12471009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C74,D1
`Chr6:12471058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:12471067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:12471114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B9,C37,C38
`Chr6:12471178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B9,C37,C38
`Chr6:12471219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B78,C14,C85
`Chr6:12471269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768652.1

482 aa

241

482

CaM_binding

PF07839 CaM_binding 374-467 aa

XP_057768653.1

482 aa

241

482

CaM_binding

PF07839 CaM_binding 374-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768652.1`	Pfam	`PF07839`	CaM_binding	Domain	374	467	3.2e-18	67.3	Plant calmodulin-binding domain
`XP_057768653.1`	Pfam	`PF07839`	CaM_binding	Domain	374	467	3.2e-18	67.3	Plant calmodulin-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912669.1
GTGTGTGAGTGTATGAAGCCAATTTTGTAAAAAATATTGTTCCTTTTTGGTTCTGTTTGTTGTAAAGCAAAGAGAATTAGGGGCATAAAAAACATAACAGGGGGAAAAGGATTTGTGTGTTGGGAATTTTGTTTGATGATCTGTTTTGGTGGGAGAAGACAGTAGTGAACTTCAAAGAAACAGATGGACTCTACTGGAGCTTCTGTTTCTCTGAACGGTTCATGCATTACTGTTGCTGCTGCTGCAGATTCTTCAAACAA...

XM_057912670.1
GGGGCATAAAAAACATAACAGGGGGAAAAGGTGGTCACATTGTTCGCATTCACAATTACAACGCCATTTTTTTTTCATATTCTGGCATTATGTTTCAATTTTGTGTTGATGCATTAGGTTTTTCGTCTGCATCGATTTGTGTGTTGGGAATTTTGTTTGATGATCTGTTTTGGTGGGAGAAGACAGTAGTGAACTTCAAAGAAACAGATGGACTCTACTGGAGCTTCTGTTTCTCTGAACGGTTCATGCATTACTGTTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988731
ATGGACTCTACTGGAGCTTCTGTTTCTCTGAACGGTTCATGCATTACTGTTGCTGCTGCTGCAGATTCTTCAAACAATGTTCCTCATTATCTCCGGCCTTCCACTGGCTCATGCCACGATATCTGTAAGTATGGACGGAGACGACCATTTGAAGAGCAGCCCACCAAACCTCTGCACAAGACAACTGCAAACCTTTCCATACTAGTAGTCCCTTCTCATCGGAGGAAGGAAACTGCCAATGGCCAACCTTTACCTTCCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768652.1
MDSTGASVSLNGSCITVAAAADSSNNVPHYLRPSTGSCHDICKYGRRRPFEEQPTKPLHKTTANLSILVVPSHRRKETANGQPLPSSHTKSFSPRAKFHSPRLNISAYAPQVVKRGIKRAQVQGNGRNSIGSRMPKPKGCQPKKSVMVKLSSPRDSLDGVCGKRRRNEDVQSGENIQSSSMLGKKPLSFNTATSDEGKTATAELLSPRKDRMRVKRVKTDPFIPSTPSLSVQEEGDRGSKMPRTGTESNEFEFRFEAITD...

XP_057768653.1
MDSTGASVSLNGSCITVAAAADSSNNVPHYLRPSTGSCHDICKYGRRRPFEEQPTKPLHKTTANLSILVVPSHRRKETANGQPLPSSHTKSFSPRAKFHSPRLNISAYAPQVVKRGIKRAQVQGNGRNSIGSRMPKPKGCQPKKSVMVKLSSPRDSLDGVCGKRRRNEDVQSGENIQSSSMLGKKPLSFNTATSDEGKTATAELLSPRKDRMRVKRVKTDPFIPSTPSLSVQEEGDRGSKMPRTGTESNEFEFRFEAITD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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