当前解析结果
SmilChr06G001219| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001219 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001219 |
| 描述 | NAC domain-containing protein 92-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 12572383 - 12573895 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988736 |
|---|---|
| GeneID | 130988736 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988736 |
| 原始查询 | LOC130988736 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NAC domain-containing protein 92-like |
| 产物 | NAC domain-containing protein 92-like |
| Arabidopsis | AT5G39610 (NAC6)NAC domain containing protein 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833957] identity=56.4; qcov=0.98; evalue=3.13e-101; confidence=high |
| Rice | Os04g0460600 (NAC2)- identity=57.3; qcov=0.781; evalue=4.15e-85; confidence=high |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02365 (NAM) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988736 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057768659.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768659.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768659.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057768659.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057768659.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:12572767 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr6:12572996 |
CTA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B11,B123,B35,B41,B73,B80,B89,C24,C3,C51,C74 |
Chr6:12573413 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B139,B8,B89,C10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768659.1PF02365
NAM 17-141 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768659.1 |
Pfam | PF02365 |
NAM | Family | 17 | 141 | 5.8e-49 | 166.3 | No apical meristem (NAM) protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。