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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001260`

染色体: Chr06 坐标: 13123120-13129487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001260`
名称	SmilChr06G001260
描述	ABC transporter B family member 19-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13123120 - 13129487 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988753`
GeneID	`130988753`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988753`
原始查询	`LOC130988753`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter B family member 19-like
产物	ABC transporter B family member 19-like
Arabidopsis	`AT3G28860` (ABCB19) ATP binding cassette subfamily B19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822519] identity=85.3; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0459000` (MDR13) - identity=81.8; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	smil02010 (ABC transporters - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF00664 (ABC_membrane)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988753

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768684.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057768684.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057768684.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768684.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13123581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C35,C69
`Chr6:13123591`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	191	A1,A10,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A25,A3,A5,A6,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B131,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B5,B52,B54,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C47,C49,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C8,C80,C82,C83,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D7,D8,D9
`Chr6:13123595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B121
`Chr6:13123603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B85,C82
`Chr6:13123605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B101,B62
`Chr6:13123616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B129,B76,B84,C45
`Chr6:13123622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B101,B62
`Chr6:13123623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C4,C45
`Chr6:13123646`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B19,B28,B39,B62,B71,C10,C11,C13,C29,C36,C57,C63,C83,D3
`Chr6:13123673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B129,B84
`Chr6:13123835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:13125001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768684.1

1252 aa

626

1252

ABC_membrane

ABC_tran

ABC_membrane

ABC_tran

PF00664 ABC_membrane 43-311 aa PF00005 ABC_tran 381-529 aa PF00664 ABC_membrane 683-954 aa PF00005 ABC_tran 1024-1175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768684.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	43	311	6.5e-107	358.0	ABC transporter transmembrane region
`XP_057768684.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	381	529	1e-65	221.2	ABC transporter
`XP_057768684.1`	Pfam	`PF00664`	ABC_membrane	Family	683	954	6.5e-107	358.0	ABC transporter transmembrane region
`XP_057768684.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	1024	1175	1e-65	221.2	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912701.1
CTCACTGCTTACTCTTCTGCGCTCTCTTTCTCTCTCTCCCTCGACACACTCTTTTACACACACACACACACCCCTCCACCTCGTTTGACCACCAGTTTACTCGTAGTCTGCTAGACTAACACTGTGTAACCCACCACTCCCCACACACTCTCTCTCTTCTTCAAGATTCTCACACCCATGCCATGCTTCCTATTTCCAAACACAACCCCATAAAAATAAAAACTCACCAAATATCAGAGCCCCTAGTTCTATATGCAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988753
ATGGCGGAAGCAGCTGAAGCTAAAGCAACGGCAAATGCAGAGAAAAAGAAAGAGCAAAGCCTGCCTTTCTATCAGCTATTTTCGTTCGCGGATAAATACGACTGCGTTTTGATGATTTCCGGCAGCCTTGGAGCTGTCATACACGGCTCCTCAATGCCTGTTTTCTTTCTGCTTTTCGGTGAAATGGTCAATGGTTTCGGTAAAAACCAAATGGATTTGCACAAAATGACACATGAAGTTGGAAAGTATGCTTTGTATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768684.1
MAEAAEAKATANAEKKKEQSLPFYQLFSFADKYDCVLMISGSLGAVIHGSSMPVFFLLFGEMVNGFGKNQMDLHKMTHEVGKYALYFVFLGLVVCCSSYAEIACWMYTGERQAGALRRKYLEAVLKQDVGFFDTDARTGDIVFSVSTDTLLVQDAISEKVGNFIHYLSTFLAGLVVGFVSAWRLALLSVAVIPGIAFAGGLYAYTLTGLTSKTRESYASAGVVAEQSIAQVRTVYSYVGESKALSAYSDLIQNTLKLGYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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