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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001247`

染色体: Chr06 坐标: 12962485-12967212 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001247`
名称	SmilChr06G001247
描述	uncharacterized SmilChr06G001247
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	12962485 - 12967212 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988758`
GeneID	`130988758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988758`
原始查询	`LOC130988758`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G39785; symbol=AT5G39785; hit=AT5G39785; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AT5G39785; symbol=AT5G39785; hit=AT5G39785; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G39785` (AT5G39785) - identity=49.1; qcov=0.616; evalue=1.92e-131; confidence=high
Rice	`Os09g0413600` (P0643D11.22-2) - identity=51.2; qcov=0.579; evalue=3.71e-115; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07891 (DUF1666)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057768695.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768695.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057768695.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057768695.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768695.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:12962806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:12962958`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B1,B107,B119,B138,B34,B48,B7,B79,C15
`Chr6:12962978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B91,C86
`Chr6:12963030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,D3
`Chr6:12963327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr6:12963658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:12963836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C17,C71
`Chr6:12965124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:12965177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768695.1

661 aa

330

661

DUF1666

PF07891 DUF1666 423-660 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768695.1`	Pfam	`PF07891`	DUF1666	Family	423	660	1.7e-88	297.2	Protein of unknown function (DUF1666)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912712.1
GCTGGCAGGTAACTATCTCTCCCTCACTTCTTCATTTCCATCTCCGATCAATTAGGTCCCCTTTCAACCTCTTCTGATTCAGATTTCTCTGCTAATTTCTTTTTTATTTTATTTTTCAGCTCAAAAGTCTATTTTCTTTTATTTATTCAAAGAAGCCATGAACTCCGCACCCGAATTTTACCCCTATTTGGTTGCTTCCATCCGAATTCAAAACCTTGATTAAAATTGCATATATCCCATGAAACAAAGAAAAAAGAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988758
ATGAGAAATCTCCAGTTTTTGAACATGGGTTCCAATCCTGGGTTTCTCTGCCAAAAACTGGTGTCTCTTTTTCATGCCATTTCTTTATTTCTGATCAAATTTATCTCCTATTTTTCCAGGTTGCAAAAATTTGGATTCTCGTCGAAGAAGAATGATAAAGATATGATATTTCTTGAAGCAGGGCGTGAAGCTGAAAATCATGATGGAGACAAATCGGAGCTGCTGCATTTGAAATTCAAGTTTCCGACGTTTGATGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768695.1
MRNLQFLNMGSNPGFLCQKLVSLFHAISLFLIKFISYFSRLQKFGFSSKKNDKDMIFLEAGREAENHDGDKSELLHLKFKFPTFDEFSRIRDVRDDSHNPKFSSSARTNTHEFTSTTTRSVTTLIEVLTTFPLREIEGEELAKVDEEITEEVEQREEEAIEGNGKKVDATEFAENKVHSVVGVVGTRDDSVDESEFYSEITSDGFLSDGALGERFDVVSDSFGENKESPMSLGEMKKVEEQDFADFLSEKDFKVNADKQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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