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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002979`

染色体: Chr01 坐标: 48729803-48734111 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002979`
名称	SmilChr01G002979
描述	uncharacterized SmilChr01G002979
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48729803 - 48734111 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988771`
GeneID	`130988771`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988771`
原始查询	`LOC130988771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0178100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0178100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G19950` (AT5G19950) tudor domain protein (DUF1767) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832117] identity=40.8; qcov=0.966; evalue=1.76e-89; confidence=medium
Rice	`Os01g0178100` - identity=42.1; qcov=0.921; evalue=1.98e-90; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF08585 (RMI1_N_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988771

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768715.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768715.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768715.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768715.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768715.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48730022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:48730076`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr1:48730076`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr1:48730099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	47	A21,A22,A4,A8,A9,B106,B108,B112,B115,B120,B122,B123,B129,B130,B137,B15,B17,B20,B21,B29,B31,B46,B51,B54,B59,B65,B77,B78,B8,B85,B88,B90,B92,B93,B95,C20,C29,C34,C47,C50,C53,C60,C61,C82,C84,C85,C9
`Chr1:48730173`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B126,B55
`Chr1:48730173`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B126,B55
`Chr1:48730187`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C81
`Chr1:48730187`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C81
`Chr1:48730191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A2,B5,B91,C9
`Chr1:48730191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B5,B91,C9
`Chr1:48730197`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C81
`Chr1:48730197`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768715.1

441 aa

220

441

RMI1_N_C

PF08585 RMI1_N_C 88-192 aa

XP_057768723.1

441 aa

220

441

RMI1_N_C

PF08585 RMI1_N_C 88-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768715.1`	Pfam	`PF08585`	RMI1_N_C	Domain	88	192	3.1e-20	73.1	RMI1, N-terminal OB-fold domain
`XP_057768723.1`	Pfam	`PF08585`	RMI1_N_C	Domain	88	192	3.1e-20	73.1	RMI1, N-terminal OB-fold domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912740.1
TATTCTCATCTCAAATTTTTTTATGAATCAATTCTCATCTCAAATTTTAATGGAGTACAATTTTTTTTTTTGAATTATAATAGAGTATAAAATTATTAAACCCAATTCTCCAAATTTTAACAATCAATCATATGCAACAATTTAGTGCCTACTTTGCAGTTGCAGGAACCGATATATGTTTAAACGGCCTCCATCTAACCATCTCCGTCGTGCCTTAGACATGGCCGCCGCCACCGCCGCTTCTCCTTCTTATTCTCCGG...

XM_057912732.1
TTTTTGAATTATAATAGAGTATAAAATTATTAAACCCAATTCTCCAAATTTTAACAATCAATCATATGCAACAATTTAGTGCCTACTTTGCAGTTGCAGGAACCGATATATGTTTAAACGGCCTCCATCTAACCATCTCCGTCGTGCCTTAGACATGGCCGCCGCCACCGCCGCTTCTCCTTCTTATTCTCCGGAGTCACAGCTCCCAGCAGCTCTCGCCGCCAGAGGCTGGTGTTTGAGAGATACGGAACGAATTCAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988771
ATGTTTAAACGGCCTCCATCTAACCATCTCCGTCGTGCCTTAGACATGGCCGCCGCCACCGCCGCTTCTCCTTCTTATTCTCCGGAGTCACAGCTCCCAGCAGCTCTCGCCGCCAGAGGCTGGTGTTTGAGAGATACGGAACGAATTCAAGAACTCATCACAGCATCTGCCACCGTCGATTCAGTTGAATCAGAGCTTCTCAATATGGACCTGCGATCGTTTGGCGGAAAATGCTTACCGCCACCTTCTCTTCTGTGCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768715.1
MFKRPPSNHLRRALDMAAATAASPSYSPESQLPAALAARGWCLRDTERIQELITASATVDSVESELLNMDLRSFGGKCLPPPSLLCKTSHLQGPIVLQVCSSRDISRSSMAEASENSGNRRLLLLKLTDGHSEITAIEYSHVPSFPDDISPGTKVRLQGKADMRNGILCLNKKVITVLGGVVQFLYEEWQLKRKYMNVSRYKLRPSQENTSSCPPPFEKLQVRTLGRGTSSTSSSEGMHVSVDTTGTSSNDHQQTLAARS...

XP_057768723.1
MFKRPPSNHLRRALDMAAATAASPSYSPESQLPAALAARGWCLRDTERIQELITASATVDSVESELLNMDLRSFGGKCLPPPSLLCKTSHLQGPIVLQVCSSRDISRSSMAEASENSGNRRLLLLKLTDGHSEITAIEYSHVPSFPDDISPGTKVRLQGKADMRNGILCLNKKVITVLGGVVQFLYEEWQLKRKYMNVSRYKLRPSQENTSSCPPPFEKLQVRTLGRGTSSTSSSEGMHVSVDTTGTSSNDHQQTLAARS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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