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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001312`

染色体: Chr06 坐标: 13604881-13607195 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001312`
名称	SmilChr06G001312
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13604881 - 13607195 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988780`
GeneID	`130988780`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988780`
原始查询	`LOC130988780`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WHAT'S THIS FACTOR 9, mitochondrial-like
产物	protein WHAT'S THIS FACTOR 9%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G58520` (AT3G58520) Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825021] identity=63.6; qcov=0.895; evalue=2.59e-176; confidence=high
Rice	`Os04g0546100` - identity=51; qcov=0.988; evalue=2.39e-122; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF11955 (PORR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988780

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768721.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768721.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768721.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768721.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13605055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:13605073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr6:13605115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C43,C78
`Chr6:13605201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B117,C27,C31,C56,C65,C70,C80
`Chr6:13605249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B84,C13
`Chr6:13605278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C43,C78
`Chr6:13605284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr6:13605386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C43,C78
`Chr6:13605409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr6:13605642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C43,C78
`Chr6:13606711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr6:13606848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768721.1

411 aa

206

411

PORR

PF11955 PORR 30-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768721.1`	Pfam	`PF11955`	PORR	Family	30	362	2e-116	389.3	Plant organelle RNA recognition domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912738.1
TGACAGCCATAATTAAAATCACCCAGATAATAAATACAATTTCTCTTGATTTGGTCCAAATAACAAAAAAATAAGGTATGAGCTGAATTCTATTTTGAATTATTTGAGAGCCCAACTTTTATCTGTAGAATTTAAATTGCAAGCCGCCTCCTTCCTTGCTTAGCTGATTGCTCAGTTACTCTGCTTCAAAGTTCAAATCTTTCTCTCATAAAGGAACTGTAGTCCATTTCTTATGATTTGATTTGATTTGCGATGAACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988780
ATGAACTCCAAGTATAAATCTCTGGCTTCATTCCCGCTCCACAATCTTCAGCATTGCCGCACAATCGCCAAAGTTCGGCTGAAATGGGTGAAAAACCGGTCTTTGGACCACATCATCGACGTCCAAACCGACATCAAAGCCGCTTGTCTCATCAAAAACGCGATCATCCGCTCTCCCACGGGATATTTGACCTCCAAATCGCTCCTCGATTCTCAGAAACTGCTGGGCCTCACCGTGCCCACTCTGCGCTTTATGCGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768721.1
MNSKYKSLASFPLHNLQHCRTIAKVRLKWVKNRSLDHIIDVQTDIKAACLIKNAIIRSPTGYLTSKSLLDSQKLLGLTVPTLRFMRRYPTLFEEYPHPKYPSLACFKLTELGMMMHHKELGVFEQCEADIIERLCRVLMMTRNHMLPFQSLHPLKWDLGLPDDFDRKLIRKYPDHFRVVKGSSGSNWLKLVGWREEFCVSALQRMNEKSIDGAPGYRGFKRGEAALEFPMSFPRGYGAQKKVKAWMDDFQKLPYISPYED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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