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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001328`

染色体: Chr06 坐标: 13793953-13797496 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001328`
名称	SmilChr06G001328
描述	F-box protein At3g58530
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13793953 - 13797496 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988789`
GeneID	`130988789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988789`
原始查询	`LOC130988789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At3g58530
产物	F-box protein At3g58530
Arabidopsis	`AT3G58530` (AT3G58530) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825022] identity=67.5; qcov=0.954; evalue=1.18e-164; confidence=high
Rice	`Os02g0281150` - identity=64.1; qcov=0.969; evalue=9.95e-161; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF13516 (LRR_6); PF25372 (LRR_FBXL15)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057768733.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057768733.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057768733.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057768733.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768733.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13794440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr6:13794718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr6:13795895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768733.1

351 aa

176

351

LRR_FBXL15

LRR_6

LRR_FBXL15

LRR_6

PF25372 LRR_FBXL15 107-221 aa PF13516 LRR_6 110-129 aa PF25372 LRR_FBXL15 147-326 aa PF13516 LRR_6 164-183 aa PF13516 LRR_6 238-260 aa PF13516 LRR_6 261-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768733.1`	Pfam	`PF25372`	LRR_FBXL15	Repeat	107	221	1.5e-21	77.1	F-box/LRR-repeat protein 15, leucine rich repeat domain
`XP_057768733.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	110	129	5.5e-15	54.9	Leucine Rich repeat
`XP_057768733.1`	Pfam	`PF25372`	LRR_FBXL15	Repeat	147	326	1.5e-21	77.1	F-box/LRR-repeat protein 15, leucine rich repeat domain
`XP_057768733.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	164	183	5.5e-15	54.9	Leucine Rich repeat
`XP_057768733.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	238	260	5.5e-15	54.9	Leucine Rich repeat
`XP_057768733.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	261	285	5.5e-15	54.9	Leucine Rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912750.1
GGGGGCAAAGTGCAAAAACTGACAGACGATCGCCAGTTTCAGTTAAGCCGCAATCAAAAGTGCAAAGAGAGAAAACGGAAGCGAAAATGGAAGTGGAAAAAGCGGAAGCAGTAGAAATATGGAACCGAGAAACAGTGCCGAAAGTGATGAAGATTGTGAGTGTGAGGCTCCCTCAAAGTGACCTGATCAATCTTTTGCTCGTCAGCCCCTGGATAAATCGGAATTTGATTTCTCACCCTTCACTGTGGCTGGTTCTTGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988789
ATGGAAGTGGAAAAAGCGGAAGCAGTAGAAATATGGAACCGAGAAACAGTGCCGAAAGTGATGAAGATTGTGAGTGTGAGGCTCCCTCAAAGTGACCTGATCAATCTTTTGCTCGTCAGCCCCTGGATAAATCGGAATTTGATTTCTCACCCTTCACTGTGGCTGGTTCTTGATTTTCATGAGATGAGTGATGCAGGGAATCGTCTTGTAGCAGCTCTCTCACTGCCGAGATACCAGAATGTGAAGCATGTAAACCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768733.1
MEVEKAEAVEIWNRETVPKVMKIVSVRLPQSDLINLLLVSPWINRNLISHPSLWLVLDFHEMSDAGNRLVAALSLPRYQNVKHVNLEFARDIEDKHLENLKNKCGNSVKNIETLNLNGCQKISDVGIEFITCNCLKLKGFSIYWNVRVSDLGIRNLVNNCKLMIDLNLSGCKNVTDESLKLIAENYQGLQLLNITRCVKLTDKSLEMVLVKCSSLQSLNLYALSSFTDAAYKRISLLTHLQFLDLCGAQNLSDDGLSCIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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