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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001289`

染色体: Chr06 坐标: 13464802-13467894 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001289`
名称	SmilChr06G001289
描述	uncharacterized SmilChr06G001289
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13464802 - 13467894 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988790`
GeneID	`130988790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988790`
原始查询	`LOC130988790`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FMN binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821082]; symbol=AT3G03890; hit=AT3G03890; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FMN binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821082]; symbol=AT3G03890; hit=AT3G03890; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G03890` (AT3G03890) FMN binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821082] identity=75; qcov=0.781; evalue=7.01e-147; confidence=high
Rice	`Os07g0573800` (OJ1562_B11.101-1) - identity=74.9; qcov=0.754; evalue=2.55e-140; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01243 (PNPOx_N); PF10615 (DUF2470); PF13883 (CREG_beta-barrel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988790

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768734.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057768734.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057768734.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768734.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13465023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C24,C72
`Chr6:13465039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B40,B82,C8
`Chr6:13465067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,A24
`Chr6:13465069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C24,C72
`Chr6:13465239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C37
`Chr6:13465251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:13465391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:13465770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B82,C8
`Chr6:13466064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr6:13466089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B113,B84,C86
`Chr6:13466098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C13
`Chr6:13466473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C82,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768734.1

333 aa

166

333

PNPOx_N

CREG_beta-barrel

DUF2470

PF01243 PNPOx_N 93-218 aa PF13883 CREG_beta-barrel 96-219 aa PF10615 DUF2470 248-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768734.1`	Pfam	`PF01243`	PNPOx_N	Domain	93	218	7.7e-12	46.3	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase
`XP_057768734.1`	Pfam	`PF13883`	CREG_beta-barrel	Domain	96	219	2.4e-12	47.9	CREG, beta-barrel
`XP_057768734.1`	Pfam	`PF10615`	DUF2470	Domain	248	322	7.4e-21	75.2	Domain of unknown function (DUF2470)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912751.1
AGGAGTATTATCTTTGATAAAATCATGTACTACGATTTTAAAAAAAAAAAAATCGAGAATTTATAATGAGACGGTTGGCATTTTGAGGGAAAGGAAGAAAGGTGTAGTTGTGGAAGAAGAGCAGAAGAAGATGAAGAGTGTCGCTTCGTCCCTACCGCATCGCTTTATCCCTCGTTTCGCTCCTTTCTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCCTCTTAGTTGGTGTTAAGATTAACAGGAACAATAATGGCGGCAATTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988790
ATGAAGAGTGTCGCTTCGTCCCTACCGCATCGCTTTATCCCTCGTTTCGCTCCTTTCTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCCCTCTTAGTTGGTGTTAAGATTAACAGGAACAATAATGGCGGCAATTATCCTTCACTCCTCTCCCCATTCAAATCGCAAACACGCATGGCTTCCACCAATCAGAGTGCTTCCACTGCCGCCGATGTCAACCCCCAACTTAATGTTTTCCAACTCATCCAAGCTCACCAGGAAAAAGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768734.1
MKSVASSLPHRFIPRFAPFFSSSSSSSLLVGVKINRNNNGGNYPSLLSPFKSQTRMASTNQSASTAADVNPQLNVFQLIQAHQEKAARLPPIEEIRTLLNYSLRGVLSTFSLKYEGYPSGSMVDFACDAYGSPILAVSSLAVHTKDLLASPRCSLLVAKDPEDRTDLVIVVHGDALPVADTDKEAIRSAYLARHPEAFWVDFGDFQFLRIEPKVVRYVSGVATALLGSGEFGKEEFRTAKVDPIYQFSKPITSHMNKDHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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