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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001252`

染色体: Chr06 坐标: 13010342-13012811 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001252`
名称	SmilChr06G001252
描述	40S ribosomal protein S9-2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13010342 - 13012811 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988807`
GeneID	`130988807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988807`
原始查询	`LOC130988807`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S9-2-like
产物	40S ribosomal protein S9-2-like
Arabidopsis	`AT5G39850` (AT5G39850) Ribosomal protein S4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833981] identity=88.8; qcov=0.954; evalue=2.77e-124; confidence=high
Rice	`Os03g0154700` (OsRPS9-2) - identity=91.3; qcov=0.934; evalue=8.71e-124; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0019843 (rRNA binding); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0045903 (positive regulation of translational fidelity)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00163 (Ribosomal_S4); PF01479 (S4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768755.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057768755.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057768755.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768755.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768755.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13010614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:13010647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B16,C82
`Chr6:13010685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr6:13011727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:13011931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B124,B125,C87,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768755.1

196 aa

196

Ribosomal_S4

PF00163 Ribosomal_S4 8-108 aa PF01479 S4 109-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768755.1`	Pfam	`PF00163`	Ribosomal_S4	Family	8	108	8.2e-15	56.0	Ribosomal protein S4/S9 N-terminal domain
`XP_057768755.1`	Pfam	`PF01479`	S4	Domain	109	153	1.8e-12	47.5	S4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912772.1
CCAGCTAAAACCCGTTCTTATAGGAGCCCAAATTAAACACTACAAGAATGGCTTAGGGTTTTGTTCACATATTTAACAGATTCTCCTCTGCAAAAACTTCCGACTTCTTCAGCTGCGTAGCTTCTTACAATGGTGCACGTTAGTTTCTACCGCAACTATGGTAAGACATTCAAGAAGCCTCGTCGGCCTTATGAGAAGGAACGATTGGATGCAGAGCTGAAGCTTGTTGGAGAGTATGGGCTCAGGTGCAAGAGGGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988807
ATGGTGCACGTTAGTTTCTACCGCAACTATGGTAAGACATTCAAGAAGCCTCGTCGGCCTTATGAGAAGGAACGATTGGATGCAGAGCTGAAGCTTGTTGGAGAGTATGGGCTCAGGTGCAAGAGGGAGCTGTGGAGGGTTCAATACGCGTTGAGTCGCATCCGTAACAATGCTAGGAATCTTCTCACCCTTGATGAAAAGGATCCCCGCCGAATCTTTGAAGGTGAGGCCCTTCTTCGCAGGATGAATAGGTATGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768755.1
MVHVSFYRNYGKTFKKPRRPYEKERLDAELKLVGEYGLRCKRELWRVQYALSRIRNNARNLLTLDEKDPRRIFEGEALLRRMNRYGLLDESQNKLDYVLSLTVENFLERRLQTLVFKAGMAKSIHHARVLIRQRHIRVGRQVVNVPSFLVRVDSQKHIDFSLTSPFGGGRAGRVKRKNQKAAAKKAGGADEEEDEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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