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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001303`

染色体: Chr06 坐标: 13558808-13562562 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001303`
名称	SmilChr06G001303
描述	protein REVEILLE 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	13558808 - 13562562 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988815`
GeneID	`130988815`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988815`
原始查询	`LOC130988815`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein REVEILLE 2-like
产物	protein REVEILLE 2-like
Arabidopsis	`AT5G37260` (RVE2) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833700] identity=63.6; qcov=0.786; evalue=5.33e-32; confidence=medium
Rice	`Os08g0157600` (CCA1) - identity=77.1; qcov=0.625; evalue=4.75e-29; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988815

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768765.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057768765.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057768765.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057768765.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057768765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:13560967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:13560973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:13561370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B86,D9
`Chr6:13561371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A13,A2,A21,A4,A8,B100,B106,B112,B118,B122,B123,B125,B131,B14,B16,B26,B30,B33,B34,B40,B46,B51,B52,B53,B58,B69,B7,B71,B72,B73,B77,B80,B84,B85,B88,B91,C10,C13,C14,C17,C30,C33,C38,C4,C46,C61,C62,C71,C77,C82,C83,D11,D2,D6,D9
`Chr6:13561379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,C35,C68,C7
`Chr6:13561386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B95,C62
`Chr6:13561420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C32
`Chr6:13561456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B67,C80,D8
`Chr6:13561457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B46,B6,C67
`Chr6:13561472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B47
`Chr6:13562246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:13562248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768765.1

112 aa

112

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 49-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768765.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	49	92	5.2e-14	52.8	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912782.1
CACCCAAATCACCCTCTTCAAAAAAAAAAAAATTCACCCAAATCACCAAATCATCTTCTTCCTTAGAATTAATCCCTCCGCCTTCGCCCGCTCCGTCCCTTCTACCTGCCACCGCGCGCCGCTCTCGCTTCAGCCGTGCGCCCCCTGCCACCCCTCCTTGCAGAGACTGCACCGCACAGTCGCGCATAGGGCTGAGCCCCTGCATGGCCTTTCCAGTCGCCCCAAGGTCCAGCCGCGCCCCCAGACTCCCCCAGAGTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988815
ATGGCCTTTCCAGTCGCCCCAAGGTCCAGCCGCGCCCCCAGACTCCCCCAGAGTTCAGACGGCCACCGCGAGCTGGCCTCGCCAGCCGGAGTCCGATTTCTCCGATTCTCTCTGACAAGGAAGCCTTACACGATTACTAAGCAGCGGGAGCGATGGACTGAAGAGGAGCACAATAGGTTTCTAGAAGCTCTCAAGCTCTATGGCCATGCTTGGCAGCGAATAGAAGAACATATAGGAACCAAGACTACTGTGCAGATAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768765.1
MAFPVAPRSSRAPRLPQSSDGHRELASPAGVRFLRFSLTRKPYTITKQRERWTEEEHNRFLEALKLYGHAWQRIEEHIGTKTTVQIRSHAHKFITKVSGRPPGVGLVQLELN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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